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针对 NNRTIs 面临的耐药突变、溶解性差等挑战,研究人员设计合成新型二芳基嘧啶(DAPY)衍生物,引入高 Fsp3 值脂肪环结构。结果显示化合物 9k 抗 HIV-1 活性优异,水溶性提升,为优化 NNRTIs 提供基础。
艾滋病(AIDS)由人类免疫缺陷病毒(HIV)引起,严重威胁全球公共健康。HIV 逆转录酶(RT)是抗病毒治疗的关键靶点,非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTIs)通过结合 RT 的非核苷结合口袋(NNIBP)发挥作用。然而,现有 NNRTIs 面临多重挑战:第一代药物如奈韦拉平(NVP)、依非韦伦(EFV)易因 K103N 等单点突变产生耐药;第二代药物如埃替拉韦(ETR)虽对早期耐药株有效,但新出现的 E138K、K103N/Y181C 等突变复合物使其疗效下降。此外,以二芳基嘧啶(DAPY)为骨架的药物(如 ETR、利匹韦林 RPV)因高度芳香结构导致水溶性差(ETR 在 pH7.0 时溶解度 <<1 μg/mL),影响药代动力学特性。因此,开发兼具更强抗耐药性和良好成药性的新一代 NNRTIs 迫在眉睫。
在此背景下,研究人员聚焦于 NNIBP 中的 “耐受区 I”—— 该区域由 F227、V106、P236、Y318 等氨基酸残基构成,呈柔性 “凹槽” 结构并暴露于溶剂,可容纳多样化化学结构,为药物设计提供了改造空间。同时,引入高 Fsp3 值(分子中 sp3 杂化碳原子的比例,衡量成药性的重要指标)的脂肪环结构,有望改善药物的水溶性、代谢稳定性等理化性质。基于此,中国研究团队以 ETR 为基本骨架,在其 “右翼” 引入哌嗪环等高 Fsp3 值脂肪环,并在环末端引入氢键供体 / 受体基团,设计合成了一系列新型 DAPY 衍生物,相关研究发表于《European Journal of Medicinal Chemistry》。
研究采用的主要技术方法包括:①有机合成:通过亲核取代、还原反应、维蒂希反应等构建目标化合物骨架,合成路线见文献 [8,14,23-27];②生物学评价:测定化合物对野生型(WT)HIV-1 及 K103N、E138K 等突变株的半数有效浓度(EC??);③分子建模:通过分子动力学(MD)模拟分析化合物与 RT 的相互作用;④水溶性评估:测定化合物在 pH7.0 条件下的溶解度。
关键研究结果
化合物合成与结构表征
通过系列化学反应合成了目标化合物,所有化合物均经熔点测定、1H/13C 核磁共振(NMR)光谱及质谱(LC-MS)确证结构,薄层色谱(TLC)用于监测反应进程。
抗病毒活性评价
所有化合物对 HIV-1 WT 株表现出中等至优异的抗病毒活性,EC??值范围为 1.2-75 nM。其中,化合物 9k活性最为突出:对 WT 株 EC??为 0.0014 μM,对 K103N 突变株 EC??为 0.0041 μM,对 E138K 突变株 EC??为 0.0077 μM,均显著优于阳性药物 ETR、NVP 和 EFV。
分子建模与作用机制分析
分子动力学模拟显示,9k 通过其哌嗪环结构深入 RT 的耐受区 I,与 F227、V106 等残基形成特异性相互作用,同时末端氢键基团与溶剂暴露区残基形成额外氢键,这解释了其对耐药突变株的强效抑制作用。
水溶性改善
9k 在 pH7.0 时的水溶性为 1.38 μg/mL,虽仍处于较低水平,但较 ETR(<<1 μg/mL)有显著提升,表明引入高 Fsp3 值脂肪环结构可有效改善 DAPY 类化合物的水溶性。
研究结论与意义
本研究通过靶向 NNIBP 耐受区 I 并引入高 Fsp3 值脂肪环结构,成功开发了一系列新型 DAPY 类 NNRTIs。其中,化合物 9k 不仅对 HIV-1 WT 株及关键耐药突变株表现出卓越的抑制活性,还通过结构优化提升了水溶性,为克服现有 NNRTIs 的耐药性和药代动力学缺陷提供了新策略。分子建模结果揭示了其与 RT 的相互作用机制,为后续化合物优化提供了理论依据。该研究为开发新一代高效、低毒、抗耐药的 HIV-1 治疗药物奠定了基础,有望推动抗逆转录病毒联合疗法(cART)的发展。