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本研究对河南东南部大别山北麓 267 份野生啮齿类粪便样本分析，发现隐孢子虫感染率 21.3%，鉴定出 5 种虫种、2 种新型基因型及 C. viatorum 新亚型 XVgA4，揭示其遗传多样性与传播风险，为隐孢子虫病防控提供科学依据。
研究背景
隐孢子虫（Cryptosporidium spp.）是重要的人兽共患病原，通过粪便传播引发腹泻，野生啮齿类因数量多、分布广成为其重要传播媒介。河南东南部大别山北麓野生动物资源丰富，但当地野生啮齿类中隐孢子虫的流行特征尚不清楚，因此开展本研究以明确该区域野生啮齿类的感染率及遗传特性。
研究方法
2023 年 3 月至 2024 年 4 月，在大别山北麓捕获 267 只野生啮齿类，采集肠道粪便样本提取 DNA。通过 PCR 扩增脊椎动物通用细胞色素 b（cytb）基因进行宿主种属鉴定，利用巢式 PCR 扩增小亚基（SSU）rRNA、肌动蛋白（actin）、热休克蛋白 70（HSP70）和 60 kDa 糖蛋白（gp60）基因，分析隐孢子虫的虫种、基因型和亚型。
研究结果
宿主与感染率
鉴定出 7 种野生啮齿类，包括大足鼠（Niviventer lotipes，117 只）、黑线姬鼠（Apodemus agrarius，98 只）等。隐孢子虫总体感染率为 21.3%（57/267），不同宿主感染率存在差异，其中黄胸鼠（Rattus tanezumi）感染率最高（33.3%，1/3），其次为大林姬鼠（Apodemus draco，22.2%，4/18）等。
虫种与基因型
检测到 5 种已知虫种：Apodemus 隐孢子虫（C. apodemi，12 例）、泛在隐孢子虫（C. ubiquitum，11 例）、Viatorum 隐孢子虫（C. viatorum，7 例）、鼠隐孢子虫（C. ratti，2 例）和隐蔽隐孢子虫（C. occultus，2 例）。此外，发现 2 种新型基因型：大鼠基因型 VI（Cryptosporidium sp. rat genotype VI，8 例）和 VII（15 例）。其中，基因型 VI 与猪隐孢子虫（C. suis）、隐蔽隐孢子虫遗传关系较近，基因型 VII 与鼠隐孢子虫亲缘关系密切。
亚型分析
对 C. viatorum 的 gp60 基因分析发现新亚型家族 XVg，其中亚型 XVgA4 通过丝氨酸重复区 TCA 三联核苷酸数目确定，其在系统发育树中与已知亚型家族 XVe、XVf 及 XVa 聚类。
季节与生境影响
感染率呈现季节性差异，秋季最高（35.6%，37/104），冬季和春季最低（8.3% 和 8.0%）；田间生境感染率（26.9%，39/145）显著高于森林（14.8%，18/122），提示气候和环境可能影响传播动态。
研究结论
本研究首次揭示大别山北麓野生啮齿类隐孢子虫的流行特征，发现 2 种新型基因型和 1 种新亚型，证实当地存在较高的传播风险。研究结果强调了野生啮齿类在隐孢子虫传播中的作用，建议在流行病学监测和防控中考虑宿主特异性及环境因素，为隐孢子虫病（Cryptosporidiosis）的防治提供重要参考。
