天然化合物薯蓣皂苷(Dioscin)通过高亲和力结合 B 细胞淋巴瘤 - 2(Bcl-2)靶向多条癌症通路的研究

【字体: 时间:2025年05月21日 来源:Current Computer-Aided Drug Design 1.5

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  本研究聚焦癌症相关生物过程(EMT、自噬、凋亡、失巢凋亡、转移)的关键基因,分析发现 Bcl-2 在多种癌症中高表达。研究人员通过分子对接等筛选出薯蓣皂苷(Dioscin),其与 Bcl-2 结合能力强,可调控相关基因,为多通路抗癌提供新方向。

  本研究旨在探索与癌症相关生物过程(包括上皮 - 间质转化(EMT)、自噬、凋亡、失巢凋亡和转移)相关的关键基因,鉴定这些生物过程相关通路中的共同基因,分析 B 细胞淋巴瘤 - 2(Bcl-2)在多种癌症中的表达水平,并从天然化合物中寻找有效的 Bcl-2 抑制剂。研究通过基因表达分析,探讨了与 EMT、自噬、凋亡、失巢凋亡和转移相关通路的共同基因,分析了其中最常过度表达的基因 Bcl-2 在多种癌症中的表达水平。通过分子对接和筛选,根据对接分数对 102 种天然化合物进行排序,选择排名靠前的分子进行 100 纳秒的分子动力学(MD)模拟,并使用 GEO2R 对薯蓣皂苷(Dioscin)进行差异基因表达分析。结果显示,在与 EMT、自噬、凋亡、失巢凋亡和转移相关的通路中鉴定出 4 个共同基因:Bcl-2、Bax、BIRC3 和 CHUK。Bcl-2 在急性髓系白血病、弥漫性大 B 细胞淋巴瘤和胸腺瘤等多种癌症中高度过表达。薯蓣皂苷在 Bcl-2 结合位点的结构获得了最高的对接分数和最相关的相互作用。通过 MM/GBSA 计算的薯蓣皂苷结合自由能为 - 52.21 kcal/mol,通过 MM/PBSA 计算的结合自由能为 - 9.18 kcal/mol。使用 GEO2R 分析的统计学显著性采用 p 值小于 0.05 判定。观察到薯蓣皂苷下调 Bcl-2、BIRC3 和 CHUK,并上调促凋亡蛋白 Bax。研究得出结论,薯蓣皂苷具有作为蛋白质抑制剂的潜力,其结合自由能值显著,且与 Bcl-2 结合位点存在相关相互作用。薯蓣皂苷可能是通过单一靶点靶向多条癌症通路的良好替代物。
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