ESKAPE 病原体多药耐药解码:遗传结构与密码子使用模式研究

【字体: 时间:2025年05月21日 来源:Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine

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  针对 ESKAPE 病原体多药耐药导致全球医疗负担加重的问题,研究人员借助多种计算工具和统计方法,对其基因组展开研究。发现翻译选择影响密码子使用偏好,亮氨酸为主要氨基酸(鲍曼不动杆菌除外),还揭示了相关基因序列及耐药基因的进化关系,为药物研发提供方向。

  
多药耐药在 ESKAPE 病原体(Enterococcus faecium、Staphylococcus aureus、Klebsiella pneumoniae、Acinetobacter baumannii、Pseudomonas aeruginosa、Enterobacter spp.)中的日益严峻挑战,已成为全球医疗工作者关注的焦点,这导致发病率和死亡率不断上升。本研究旨在阐明 ESKAPE 病原体的遗传结构,以改善其致病性并推动药物研发工作。研究人员运用一系列全面的计算工具和统计方法,对 ESKAPE 病原体的基因组进行了详细分析。

结果表明,翻译选择对该病原体群体内的密码子使用偏好产生了深远影响。值得注意的是,除鲍曼不动杆菌中精氨酸占主导外,亮氨酸是主要的氨基酸。所有 ESKAPE 病原体普遍至少偏好一个组氨酸密码子。在所有 ESKAPE 病原体中,GpC 是密码子对连接处最显著过度代表的二核苷酸。此外,gyrB 基因序列的比较和系统发育树的构建显示,富 AT 和富 GC 的 ESKAPE 病原体之间存在明显的进化关系。同时,对多个抗生素耐药基因的鉴定、表征和系统发育分析揭示了不同的进化关系。

结论显示,尽管病原体的抗生素耐药基因存在显著差异,但亮氨酸仍是主要的氨基酸。

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