溶组织内阿米巴EhSec1与EhSyntaxin1A/1B的分子对接及动态模拟揭示其互作机制

来自印度的研究人员针对溶组织内阿米巴（Entamoeba histolytica）分泌系统的关键调控蛋白EhSec1展开研究，通过分子对接和动态模拟技术解析其与SNARE蛋白（EhSyntaxin1A/1B）的互作界面及关键氨基酸残基。研究发现EhSec1通过结构域1（53D、60K、62E）和3a（259K、314N）与Syntaxin的Hc区（110R、114N）及SNARE基序（234E、237E、242E）形成14个强氢键（<2.4 ?），同时揭示EhRabX10通过G3区与EhSec1结构域2结合。该研究为靶向EhSec1的抗阿米巴药物设计提供了理论依据。

　　

这项研究深入探究了溶组织内阿米巴（Entamoeba histolytica）分泌系统的核心调控因子——EhSec1蛋白的分子特性。作为Sec1/Munc18-1样（SM）蛋白家族成员，EhSec1在囊泡运输中扮演关键角色。通过生物信息学分析和分子模拟技术，研究团队发现这个70kDa的球状蛋白具有独特的三维结构：结构域1和2呈现经典的α-β-α折叠，而结构域3则分为3a和3b两个部分，彼此呈56.7°夹角。

分子动力学模拟揭示了EhSec1与Syntaxin1A的稳定互作机制——双方通过14个强氢键（键长<2.4 ?）形成紧密复合体。关键互作残基集中在EhSec1的结构域1（53D、60K、62E）和3a（259K、314N），以及Syntaxin的Hc区（110R、114N）和SNARE基序（234E、237E、242E）。有趣的是，研究还发现小G蛋白EhRabX10通过其G3区与EhSec1结构域2（224R-225H、490L-495F、518K）特异性结合。

这些发现不仅阐明了EhSec1在溶组织内阿米巴分泌系统中的核心作用，更为重要的是为开发靶向囊泡运输通路的新型抗阿米巴药物提供了精确的分子靶点。该研究通过计算机模拟手段，成功构建了SNARE介导的囊泡运输最小功能单元模型，为理解病原体侵袭机制开辟了新视角。