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针对现有 VEGFR2抑制剂选择性低、副作用等局限,研究人员基于 CADD 技术,以 VEGFR2(PDB:4ASD)为靶点构建虚拟化合物库,经分子对接和动力学模拟筛选出 10 个潜力抑制剂,其中 Compound 9 表现更优,为靶向药物开发提供新方向。
目的:目前血管内皮生长因子受体 2(VEGFR2)抑制剂的应用常受限于低选择性和副作用,迫切需要靶向该受体的新型高选择性药物。方法:基于现有 VEGFR2抑制剂,利用计算机辅助药物设计(CADD)技术,通过活性对接片段构建虚拟化合物库。以 VEGFR2构象(PDB:4ASD)为受体蛋白进行分子对接,经对比分析和筛选确定最有潜力的抑制剂,并通过分子动力学模拟验证。结果:从虚拟库中鉴定出 10 个潜在高活性抑制剂,尤其是 Compound 9 与蛋白构象结合亲和力强,对接时形成 4 个氢键,计算的 CODOCKER 能量为 39.7315 kcal/mol,均方根偏差(RMSD)为 0.4634 nm,均方根波动(RMSF)为 0.3234 nm,与索拉非尼(Sorafenib)相比,显示出更优的对接选择性和活性。结论:计算分析表明 Compound 9 是有前景的高选择性 VEGFR2抑制剂候选化合物,但鉴于计算机模拟研究的固有局限性,需进一步化学合成和生物实验验证其潜力。
关键词:VEGFR2抑制剂;虚拟化合物库;分子对接;分子动力学模拟;计算机辅助药物设计;受体酪氨酸激酶