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重症肌无力（MG）是自身免疫病，30% 胸腺瘤患者伴发 MG（TAMG），其与非 MG 胸腺瘤（NMG）的基因表达差异尚不明确。研究人员分析 TAMG 与 NMG 的 DEGs 及其调控 miRNA，鉴定出 5 个枢纽基因，且与免疫细胞浸润等相关，为阐明机制和免疫治疗提供新靶点。
重症肌无力（Myasthenia Gravis, MG）是一种自身免疫性疾病，约 30% 的胸腺瘤患者会合并重症肌无力。胸腺瘤相关性重症肌无力（Thymoma-Associated MG, TAMG）与非重症肌无力胸腺瘤（Non-MG Thymoma, NMG）患者在临床表现上存在诸多差异，但其基因表达差异仍不明确。本研究旨在分析 TAMG 中的差异表达基因（Differentially Expressed Genes, DEGs）并探究其调控的微小 RNA（microRNA, miRNA），以进一步阐明 TAMG 可能的发病机制。
研究人员利用从癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas, TCGA）数据库下载的 TAMG 和 NMG RNA 测序数据计算 DEGs，通过 R 软件对 DEGs 进行基因本体论（Gene Ontology, GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）通路分析，借助 STRING 构建蛋白质 - 蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction, PPI）网络，并使用 Cytoscape 识别和可视化枢纽基因。同时，通过 TIMER 数据库和 TCGA 数据库探讨枢纽基因的免疫浸润意义，利用在线软件预测枢纽基因的上游 miRNA。
结果显示，TAMG 与 NMG 组间共鉴定出 977 个 DEGs（|log fold change (FC)| >2，调整后 P 值 < 0.050），其中 555 个基因下调，422 个基因上调。在 PPI 网络中识别出 5 个顶级枢纽基因：CTNNB1、EGFR、SOX2、ERBB2 和 EGF。基于 TIMER 和 TCGA 数据库的分析表明，这 5 个枢纽基因与 TAMG 患者的多种免疫细胞浸润及免疫检查点相关标志物（如 PDCD1、CTLA-4 和 CD274）相关。最后，鉴定出 5 个可能调控枢纽基因表达的 miRNA。
本研究在 TAMG 中鉴定出 5 个枢纽基因（CTNNB1、EGFR、SOX2、ERBB2 和 EGF）及其 5 个调控 miRNA，且枢纽基因与多种免疫细胞浸润和免疫检查点相关标志物相关。研究结果有助于部分阐明 TAMG 的病理生理学机制，可为后续临床免疫治疗提供新的潜在靶点。
