基于多步骤计算机模拟方法筛选 FDA 批准的 SARS-CoV-2 解旋酶潜在抑制剂：COVID-19 治疗的新前景

为应对 COVID-19，研究人员利用先进计算机方法从 3009 种临床及 FDA 批准药物中筛选 SARS-CoV-2 解旋酶潜在抑制剂。以解旋酶共结晶配体 VXG 为参照，经分子指纹、结构相似性分析等，确定 9 种有潜力化合物，为后续研究提供方向。

　　

在这项对抗 COVID-19 的研究中，研究者通过先进的计算机模拟方法，从 3009 种临床药物和 FDA 批准药物中筛选 SARS-CoV-2 解旋酶的潜在抑制剂。研究以解旋酶的共结晶配体 VXG 为核心，首先通过分子指纹分析和结构相似性研究缩小候选范围，初步筛选出 29 种与 VXG 结构最相似的化合物。随后，针对 SARS-CoV-2 解旋酶（PDB ID：5RMM）开展分子对接、分子动力学（MD）模拟和分子力学 - 泊松玻尔兹曼表面积（MM-PBSA）研究，以验证候选化合物与蛋白活性位点的结合潜力。最终鉴定出 9 种具有良好潜力的 SARS-CoV-2 解旋酶抑制剂，包括茴拉西坦、阿司匹林、色满卡林、肉桂酸、 Lawsone（2 - 羟基 - 1,4 - 萘醌）、洛索洛芬、苯乙醛酸和抗肿瘤素 A10。本研究结果为科学界进一步开展体外（in vitro）和体内（in vivo）研究提供了重要参考。