红树林沉积物中新型几丁质降解菌——Chitinibacter mangrovi sp. nov.的发现及其分类学特征解析

【字体: 时间:2025年05月22日 来源:Current Microbiology 2.3

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  来自中国广西的研究人员从红树林沉积物中分离出一株具有几丁质降解能力的细菌FCG-7T,通过多相分类学方法鉴定其为Chitinibacter属新种。该菌株最适生长条件为30°C、pH 7-8和0.5% NaCl,主要脂肪酸为summed feature 3(C16:1 ω6c/ω7c)和C16:0,基因组GC含量53.8%。与近缘种Chitinibacter bivalviorum和C. fontanus的ANI值仅81.4-83.1%,dDDH值22.9-24.3%,确证其新种地位,命名为Chitinibacter mangrovi sp. nov.,为海洋微生物资源开发提供新菌种。

  

在广西北部湾红树林的神秘沉积层中,科学家们捕获了一类擅长分解几丁质(chitin)的微生物猎手——菌株FCG-7T。这群革兰氏阴性(Gram-stain-negative)的杆状细菌在30°C的温暖环境里最为活跃,能耐受弱碱环境(pH 7-9),其菌落如同稀释的珍珠乳液般呈现乳白色。

生化分析揭示其细胞工厂的独特配方:呼吸链采用泛醌-8(Q-8)作为能量货币,细胞膜富含特征性脂肪酸组合(summed feature 3含C16:1 ω6c/ω7c与C16:0),磷脂双分子层中驻扎着磷脂酰乙醇胺(PE)和双磷脂酰甘油(DPG)等特殊兵种。基因组测序显示其DNA的GC含量锁定在53.8%,相当于每十个碱基对中就有五个是鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)的紧密组合。

尽管16S rRNA基因与近亲Chitinibacter bivalviorum 2T18T(相似度99.29%)和C. fontanus STM-7T(98.85%)高度同源,但全基因组层面的数字身份认证(ANI 81.4-83.1%)和虚拟DNA杂交实验(dDDH 22.9-24.3%)都确凿证明:这株来自潮间带的微生物实乃Chitinibacter家族的新成员,最终被冠以Chitinibacter mangrovi sp. nov.的学名,其标准菌株FCG-7T已入驻韩国典型菌种保藏中心(KCTC 8742T)和广东省微生物菌种保藏中心(GDMCC 1.4868T)。

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