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土耳其西瓜花叶病毒(WMV)遗传多样性及系统发育分析:揭示新兴与经典种群演化特征
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月22日 来源:Current Microbiology 2.3
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为解决土耳其西部黑海和安纳托利亚中部地区西瓜花叶病毒(WMV)遗传多样性认知不足的问题,研究人员通过RT-PCR、MEGA11系统发育分析和DnaSP v6.12.03群体遗传学手段,对19个WMV分离株的CP基因进行解析。研究发现土耳其分离株分属"新兴(EM)"和"经典(G1)"两大群组,并鉴定出新次要分支,揭示G1群组遗传分歧度较低(ω=0.022-0.243)、存在近期扩张现象,为WMV分子防控提供重要理论依据。
西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus, WMV)作为葫芦科作物的头号病原体,在土耳其西部黑海和安纳托利亚中部地区肆虐横行。科研团队这次玩起了"病毒侦探"游戏,用RT-PCR技术当放大镜,MEGA11作进化时钟,DnaSP v6.12.03变身基因计算器,对19个来自不同葫芦科宿主的WMV分离株展开全基因组"体检"。
有趣的是,这些土耳其病毒"居民"在进化树上分成了两大阵营:8个是时髦的"新兴派(EM)",11个属于保守的"经典派(G1)",还意外发现了个小众家族。虽然全球样本KP164988检测到基因"混搭"现象,但土耳其本土毒株却保持着"血统纯正"。
基因多样性分析显示,G1组就像个守旧的大家族,变异程度(ω=0.022-0.243)明显低于标新立异的EM组。所有病毒种群都经历着严苛的"自然选择大考",近期还出现了人口扩张迹象——这多半要归功于新报道毒株带来的基因"新面孔"。研究不仅坐实了EM和G1组间的"生殖隔离",还发现土耳其病毒圈和全球群体频繁"跨国联姻"。这项研究就像给WMV拍了张高清"基因身份证",为后续设计精准防控策略提供了关键线索。
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