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为解决胰腺癌治疗响应评估难题,研究人员在 CheckPAC 和 PACTO 试验中,利用肿瘤知情(WGMAF)和非依赖肿瘤(ARTEMIS-DELFI)的 cfDNA 分析方法监测疗效。发现两类方法均能预测生存,ARTEMIS-DELFI 经外部验证,为无创监测提供新途径。
胰腺癌是恶性程度极高的消化道肿瘤,2020 年全球约 45 万人因它离世,其中多数为胰腺导管腺癌(PDAC)。晚期患者预后极差,5 年生存率仅 12%。目前临床主要依靠影像学(如 CT)和血清 CA19-9 评估治疗响应,但 CT 可能因免疫治疗后的伪进展等误导判断,且部分患者肿瘤不分泌 CA19-9,导致评估受限。因此,亟需无创、实时且准确的疗效评估方法。
丹麦哥本哈根大学医院的研究人员开展了相关研究,旨在探索基于游离 DNA(cfDNA)的无创方法在胰腺癌治疗监测中的应用。研究成果发表在《SCIENCE ADVANCES》。
研究用到的主要关键技术方法包括:
- 肿瘤知情的全基因组突变等位分数(WGMAF)分析:对肿瘤和正常样本进行全基因组测序(WGS),检测体细胞突变,计算 cfDNA 中突变片段占比。
- 肿瘤非依赖的 ARTEMIS-DELFI 分析:结合 cfDNA 片段化特征(DELFI)和重复元件景观(ARTEMIS),通过低覆盖 WGS 生成综合评分。
- 研究涉及两个临床队列:CheckPAC 试验(晚期患者接受免疫联合放疗)和 PACTO 试验(初治患者接受化疗),分析血浆样本的 cfDNA 并关联临床结局。
患者队列与研究设计
CheckPAC 试验纳入 84 例转移性胰腺癌患者,43 例样本用于分子分析,患者接受放疗联合纳武利尤单抗 ± 伊匹木单抗治疗,采集治疗前后血浆及肿瘤活检样本。PACTO 试验纳入 147 例初治患者,40 例样本用于分析,接受吉西他滨 / 纳米紫杉醇 ± 托珠单抗治疗,定期采集血浆。通过对比治疗前后的 cfDNA 特征与影像学(RECIST 1.1)、CA19-9 等传统指标,评估两种 cfDNA 方法的预测效能。
肿瘤知情的 WGMAF 方法
对 37 例患者的肿瘤和正常样本进行 WGS,检测到 KRAS(82%)和 TP53(75%)等常见突变。通过计算治疗后 cfDNA 的 WGMAF 值,发现分子响应者(WGMAF 低于中位数)的中位总生存期(OS)显著长于非响应者(319 天 vs 126 天,HR=0.29),无进展生存期(PFS)也更长(157 天 vs 51 天)。多变量分析显示,WGMAF 是 OS 的独立预测因子。
全基因组 cfDNA 片段化分析
分析 cfDNA 片段大小分布、染色体拷贝数变异(CNV)及染色质结构,发现治疗后部分响应患者的 CNV 负荷低于稳定或进展患者。结合片段化特征和重复元件的 ARTEMIS-DELFI 评分显示,治疗后低评分患者 OS 更长(233 天 vs 172 天,HR=0.12),且可在治疗 2 周后快速预测 “治疗失败”(高评分患者 OS 更短)。多变量分析证实 ARTEMIS-DELFI 评分是 OS 的独立预测因子。
与传统方法的比较
RECIST 1.1 在治疗 8 周时无法区分患者 OS,而 CA19-9 仅在分泌型患者中与 cfDNA 指标弱相关。WGMAF 和 ARTEMIS-DELFI 评分高度相关(R=0.84),且在无肿瘤组织的 PACTO 试验中,ARTEMIS-DELFI 仍能预测 OS(分子响应者 288 天 vs 非响应者 199 天),验证了其通用性。
结论与意义
本研究开发的 WGMAF(基于肿瘤突变)和 ARTEMIS-DELFI(基于片段化特征)两种 cfDNA 方法,均能无创、准确地评估胰腺癌患者的治疗响应和生存预后。ARTEMIS-DELFI 无需肿瘤组织,适用于更广泛患者,且在早期预测(如 2 周)中表现优异。这些发现为胰腺癌的实时疗效监测提供了新工具,有望指导临床及时调整治疗策略,改善患者预后。未来需在更大样本和其他癌种中进一步验证,推动液态活检在精准肿瘤学中的应用。