柑橘感染亚洲韧皮部杆菌(CLas)过程中 microRNA、phasiRNA 和 hc-siRNA 的特征分析及对互作机制的新见解

【字体: 时间:2025年05月23日 来源:Horticulture, Environment, and Biotechnology 2.5

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  microRNA、phasiRNA 和 hc-siRNA 在植物转录后调控与免疫中具重要作用,但在柑橘(Citrus sinensis)应对亚洲韧皮部杆菌(CLas)感染中的角色尚不明确。研究通过深度测序与生物信息学分析,鉴定出差异表达的小 RNA 及其靶基因,相关通路富集于酶活性与糖代谢,为解析柑橘 - CLas 互作机制提供新视角。

  
microRNA(miRNA)、phased small interfering RNA(phasiRNA)和 heterochromatic small interfering RNA(hc-siRNA)是参与转录后调控和植物免疫的重要小分子 RNA。亚洲韧皮部杆菌(Candidatus Liberibacter asiaticus,CLas)感染柑橘(Citrus sinensis)过程中,这些小分子 RNA 的作用机制尚未明确。本研究通过深度测序和生物信息学分析,系统鉴定并分析了柑橘响应 CLas 感染的 miRNA、phasiRNA 和 hc-siRNA,同时预测差异表达 miRNA 的靶基因并进行功能富集分析。研究共鉴定到 121 个 miRNA、352 个 phasiRNA 和 93,162 个 hc-siRNA,其中 43 个成熟 miRNA 和 55 个 phasiRNA 在 CLas 感染与未感染样本间呈现差异表达。靶基因富集分析显示,其显著参与 ATP 酶活性、核苷三磷酸酶活性、焦磷酸酶活性、水解酶活性及碳水化合物代谢相关通路。本研究不仅深化了对这些小分子 RNA 生物学功能的理解,也为揭示柑橘与 CLas 互作的分子机制提供了新方向。

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