中国半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）盲侧 hypermelanosis 的差异甲基化分析：揭示复杂基因调控网络与经济鱼类体色异常机制

中国半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）养殖中盲侧 hypermelanosis 导致严重经济损失。研究人员通过分析正常与患病鱼眼侧和盲侧皮肤组织，利用集合分析筛选出可能、潜在及直接差异甲基化区域（DMRs），发现相关基因富集于骨骼系统和胚胎器官形态发生，揭示其受遗传与环境共同调控的复杂机制。

　　

中国半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）养殖中，盲侧皮肤过度黑化（hypermelanosis）是养殖户面临的主要问题，可造成重大经济损失。本研究为探究 DNA 甲基化与该病症的关联，选取正常和黑化个体的眼侧与盲侧皮肤组织，通过集合分析筛选出可能（2278 个）、潜在（1015 个）及直接（6740 个）差异甲基化区域（DMRs），分别对应 1786、908 和 4210 个基因。富集分析显示，携带与 hypermelanosis 相关 DMRs 的基因参与形态发生过程中的骨骼系统和胚胎器官发育。通过与已报道的转录组、非编码 RNA（ncRNA）及遗传学研究结果对比，发现数十个关键基因重叠。这些结果表明，半滑舌鳎盲侧 hypermelanosis 是受遗传因素和环境条件共同影响、由复杂基因网络调控的复杂性状。