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COVID-19代谢组学进展:基于1H NMR的血清代谢标志物预测疾病严重程度与预后的研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月23日 来源:Metabolomics 3.5
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为解决COVID-19患者风险分层难题,丹麦奥尔堡大学医院团队通过1H NMR代谢组学分析106例患者血清样本,构建了基于炎症标志物(GlycA)、脂蛋白(HDL-C/LDL-TG)及氨基酸(苯丙氨酸)等20种代谢物的预测模型,其ROC曲线AUC达0.98,可精准区分轻/重症及死亡/存活患者,为临床早期干预提供新策略。
COVID-19大流行暴露了医疗系统对重症患者早期识别的迫切需求。尽管多数患者症状轻微,约14%会发展为重症,其中5%面临生命威胁,死亡率达2.3%。现有临床指标如血氧饱和度<94%或呼吸频率>30次/分虽能识别重症,但患者此时已需紧急ICU干预。更棘手的是,COVID-19的病理机制复杂,既有典型炎症反应(如细胞因子风暴),又涉及血管病变和凝血异常(vasculopathy and coagulopathy),而干扰素应答(interferon responses)等机制尚不明确。这种认知缺口使得精准预测疾病进展和开发靶向治疗举步维艰。
丹麦奥尔堡大学医院联合多家机构的研究团队在《Metabolomics》发表研究,通过核磁共振(1H NMR)代谢组学技术分析了丹麦队列中106例COVID-19患者(含轻症至死亡全病程)及37例非COVID对照的240份血清样本。研究结合随机森林(RF)和sPLS-DA等机器学习算法,首次系统揭示了COVID-19代谢重编程的动态特征,并建立了可临床转化的预测模型。
关键技术包括:1)使用600 MHz Bruker AVANCE III HD NMR谱仪定量172种代谢物(含脂蛋白亚类及氨基酸);2)采用递归特征消除(RFE)筛选关键生物标志物;3)通过ROC曲线和四种机器学习模型(随机森林、线性支持向量机等)验证预测效能;4)纵向追踪20例重症患者治疗前后代谢变化。
代谢特征区分疾病严重程度
PCA分析显示,轻症患者代谢谱接近非COVID对照组,而重症存活者(COV-L)与因其他疾病死亡者(Other-D)聚类重叠。死亡患者(COV-D)则呈现独特代谢模式。随机森林筛选出20个关键代谢物,包括炎症标志物糖蛋白乙酰化(GlycA)、组氨酸(His)及脂蛋白(如S-HDL-CE)。其中GlycA和苯丙氨酸(Phe)随病情加重显著上升(p<0.001),而HDL相关代谢物(S-HDL-C/P)则递减,提示脂代谢紊乱与疾病恶化相关。
预测模型构建与验证
针对轻症转重症的预测,12种代谢物组合(含白蛋白、LDL-TG等)的PLS-DA模型AUC达0.98。对于死亡风险预测,16种HDL相关标志物(如HDL-P、ApoA1)的随机森林模型AUC为0.84。值得注意的是,酮体(乙酰乙酸)在康复患者中持续升高,而肌酐在死亡组维持高位,提示能量代谢失衡是预后关键。
死亡患者的代谢特异性
COVID-19死亡者(COV-D)与其他疾病死亡者(Other-D)的sPLS-DA区分准确率达76%。前者表现为极大颗粒VLDL(XXL-VLDL-TG)升高和大型HDL(L-HDL-CE)降低,这种"脂蛋白倒置"现象可能反映肝脏合成功能衰竭。
该研究首次建立覆盖COVID-19全病程的代谢图谱,揭示脂代谢紊乱(如HDL颗粒减少)、氨基酸失衡(苯丙氨酸累积)和能量危机(酮体变化)是驱动病情恶化的三大核心机制。其创新性在于:1)将代谢组学与机器学习结合,实现80%的病程预测准确率;2)发现HDL亚类(如S-HDL-CE)可作为新型预后标志物;3)证实代谢干预(如调节苯丙氨酸水平)的潜在治疗价值。这些发现为开发快速分诊工具和靶向代谢疗法提供了分子基础,尤其对医疗资源调配具有重要实践意义。
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