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神经组织ATAC-seq技术优化方案:解析神经发育与疾病表观遗传调控的新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月23日 来源:Anatomical Science International 1.2
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为解决神经组织中染色质完整性保存难题,研究人员开发了针对神经细胞的特异性ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)方案。该优化流程通过改进组织处理、核分离和转座反应步骤,仅需2×104-5×104个细胞即可高灵敏度检测神经可塑性、发育障碍及相关疾病的调控元件,为神经表观基因组学研究提供标准化工具。
ATAC-seq(转座酶可及染色质测序技术)作为解析染色质开放状态的高分辨率工具,在神经科学研究中发挥着关键作用。最新优化的实验方案专门针对神经组织特性,通过精密设计的组织处理流程和核分离技术,有效克服了神经细胞染色质易降解的难题。
技术核心在于改良的转座酶(Tn5)反应体系,配合神经特异的文库构建方法,仅需2万至5万个细胞即可精准捕获与神经发育、突触可塑性相关的调控元件。该方案对阿尔茨海默病等神经退行性病变相关的表观遗传标记具有卓越检测灵敏度,其标准化流程适用于各类神经疾病模型和类器官研究。
值得注意的是,该技术能同步解析转录因子结合位点和核小体定位信息,为揭示神经环路形成、记忆编码等过程的表观遗传调控机制提供了全新研究范式。实验数据显示,优化后的方法在检测下丘脑、海马等复杂脑区时,较传统方案显著提高信噪比,特别适用于单细胞水平的多组学整合分析。
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