约旦番木瓜中新马铃薯 Y 病毒属病毒的鉴定及全基因组序列分析

为明确约旦河谷番木瓜（Carica papaya）病毒样症状病原，研究人员通过高通量测序开展病毒鉴定及基因组分析。发现 1 种新型马铃薯 Y 病毒属（Carlavirus）病毒，全基因组 9,169 nt，含预测 ORF6，与黄瓜脉明病毒（CvCV）分离株衣壳蛋白、复制酶蛋白氨基酸序列一致性分别约 94%、69%，被认定为该属新成员并命名 “番木瓜病毒 B”，揭示其在多地番木瓜种植区的感染现状。

　　

2022 年，研究人员在约旦约旦河谷开展田间调查时，通过高通量测序从番木瓜（Carica papaya）样本中发现一种新型马铃薯 Y 病毒属（Carlavirus）病毒。该病毒全基因组序列长 9,169 nt，具有该属成员典型的基因组结构，包括一个预测的开放阅读框 6（ORF6^①）。衣壳蛋白和复制酶蛋白的氨基酸序列比对显示，其与黄瓜脉明病毒（CvCV）分离株的一致性分别约为 94% 和 69%。根据国际病毒分类委员会（ICTV）基于序列一致性值的分类标准，该病毒被认定为马铃薯 Y 病毒属的一个假定新成员，建议将其通用名称定为 “番木瓜病毒 B”。田间调查显示，从约旦河谷五个田间采集的 38 份具有明显病毒样症状的番木瓜样本中，有 20 份检测到该病毒，表明这种新型马铃薯 Y 病毒属病毒在不同种植区域的番木瓜中均有感染发生。

① 注：ORF 为开放阅读框（Open Reading Frame）的英文缩写。