BIOFIRE FILMARRAY肺炎检测面板在疑似肺炎中的真实世界性能评估：与传统培养方法的比较及临床启示

这篇研究通过真实世界数据评估了BIOFIRE FILMARRAY肺炎面板（BF-PP）与传统培养方法的性能差异。结果显示，BF-PP对细菌和病毒的总体检出率为44.8%，在确诊肺炎患者中升至64.6%，且检测速度显著快于培养（75分钟 vs. 48小时）。尽管对常见呼吸道定植菌（如肺炎链球菌、流感嗜血杆菌）的检测存在一定假阳性，但其阳性符合率（PPA）和阴性符合率（NPA）分别达91.4%和83.6%，尤其在支气管肺泡灌洗液（BAL）标本中一致性最高（90.2%）。研究强调了该技术在指导抗生素精准使用（如缩短升级时间、促进降阶梯治疗）中的潜力，同时指出区分病原体与定植菌仍是临床应用的挑战。

　　

ABSTRACT
肺炎的病原学诊断长期面临挑战，传统培养方法因耗时长（48小时）、检出率低（20%-40%）而受限。BIOFIRE FILMARRAY肺炎面板（BF-PP）作为多重核酸检测技术，可在75分钟内同时检测18种细菌、8种病毒及7种耐药基因，为临床提供快速病原学依据。这项回顾性研究基于563份呼吸道标本（含254份肺炎确诊患者标本）的分析显示，BF-PP总体检出率（44.8%）显著高于培养（35.3%），且在肺炎组中差异更显著（64.6% vs. 55.5%）。值得注意的是，金黄色葡萄球菌（S. aureus）以26.5%的检出率成为肺炎组最常见病原体，而肺炎链球菌（S. pneumoniae）仅占7.6%，反映了疫苗时代病原谱的变化。

IMPORTANCE
研究特别指出，BF-PP与培养结果的差异集中体现在"常见呼吸道菌群组"（URM组：肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等）。通过实验室复检发现，BF-PP检测为阳性但培养报告为"正常菌群"的标本中，实际上存在目标菌的非优势生长。这种差异可能源于抗生素预处理抑制培养生长，或BF-PP对死菌DNA的敏感性。耐药基因检测方面，mecA/C与MRSA培养的符合率达81.3%（13/16），而bla_CTX-M对产ESBL肠杆菌的预测准确性为80%（8/10），凸显其在耐药性快速筛查中的价值。

INTRODUCTION
肺炎的异质性病因随疫苗普及和耐药菌演变而动态变化。当前经验性抗生素治疗导致约30%-50%患者接受不恰当治疗，加剧耐药危机。BF-PP的自动化设计可减少人工操作，但其高灵敏度带来的临床解读难题尚未解决。本研究通过随机对照试验（RCT）的子分析，首次系统评估了BF-PP在不同呼吸道标本（痰液、气管分泌物、BAL）及肺炎亚型（CAP/HAP/VAP）中的性能特征。

MATERIALS AND METHODS
研究纳入2020-2022年梅奥医学中心收治的疑似肺炎成人患者，采用前瞻性随机分组设计。标本预处理严格遵循质量规范（如痰标本需通过革兰染色筛选）。BF-PP采用全自动样本-结果系统，细菌载量以10⁴-10⁷ copies/mL分级报告。统计学分析采用SAS 9.4，通过阳性符合率（PPA）、阴性符合率（NPA）及精确二项95%置信区间评估性能。

RESULTS
• 检出率差异：BAL标本的BF-PP阳性率最低（18.1%），但肺炎组中升至45.1%；而气管分泌物在肺炎组达73.1%阳性率。
• 病原谱特征：除S. aureus外，肺炎组中铜绿假单胞菌（P. aeruginosa, 10.9%）和肺炎克雷伯菌（K. pneumoniae, 6.7%）占比突出。病毒检出率仅7.5%，可能与COVID-19流行期其他病毒传播受抑制有关。
• 性能指标：非发酵革兰阴性杆菌组的PPA最高（92.5%），而肠杆菌目细菌的PPA波动较大（84.6%）。BAL标本的NPA普遍高于其他标本（URM组达91.7%）。
• 载量-生长相关性：高基因组载量（≥10⁶ copies/mL）与培养高生长（+3/+4）显著相关（S. aureus 71.4%，肠杆菌目61.5%），但URM组仅36.6%呈现高生长。

DISCUSSION
研究揭示了BF-PP在真实临床场景中的双重价值与挑战：

1. 技术优势：较传统培养缩短诊断时间约46倍，对MRSA和ESBL的快速识别可优化抗生素选择。
2. 解读困境：URM组细菌的高检出率（如68.6%低载量标本被报为正常菌群）提示需结合临床判断。
3. 未解之谜：35%肺炎病例仍无病原学解释，暗示现有检测范围或对新型病原体的认知存在空白。

该研究为分子诊断时代肺炎管理的范式转变提供了证据，强调需建立基于病原体载量、标本来源和宿主因素的联合解读模型。未来研究应关注BF-PP指导下的治疗决策对患者预后的实际影响，特别是在耐药菌高发地区的应用价值。