自动化分子检测揭示美国不同人群生殖支原体大环内酯类耐药性分布及核酸载量相关性研究

【字体: 时间:2025年05月23日 来源:Microbiology Spectrum 3.7

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  这篇研究通过高通量自动化系统(Panther Fusion)对2,145例生殖支原体(M. genitalium)阳性样本进行大环内酯耐药突变(MRM)检测和16S rRNA半定量分析,发现MSM(男男性行为者)和大学生群体耐药率(62.0%和60.8%)显著高于社区人群(43.2%),且症状患者耐药率更高(71.4% vs 46.7%)。研究证实核酸载量(log10 TMA滴度≥4)与MRM检出率显著相关(87.7% vs 29.3%),为临床耐药检测策略提供了重要流行病学依据。

  

ABSTRACT
最新研究优化了基于Panther Fusion系统的实时逆转录PCR实验室自建检测(LDT),用于从原代拭子和尿液标本中检测生殖支原体(M. genitalium)大环内酯耐药相关突变(MRM)。该MRM-LDT应用于大型多人群研究,对2,145例经转录介导扩增(TMA)检测为阳性的临床标本进行16S rRNA半定量分析,并通过10倍系列稀释确定相对核酸载量。结果显示社区医疗、大学生和MSM人群的MRM检出率分别为43.2%、60.8%和62.0%,且症状患者的耐药率显著升高(P=0.005)。

INTRODUCTION
随着FDA批准的核酸扩增检测(NAAT)技术进步,临床面临生殖支原体对一线大环内酯药物治疗失败的挑战。美国CDC建议根据大环内酯耐药检测结果制定个体化治疗方案,但传统培养和药敏试验耗时较长。分子检测虽已开发,但尚未获FDA批准广泛应用。本研究团队此前优化的MRM-LDT与Sanger测序一致性达91%,为高通量检测提供可能。

MATERIALS AND METHODS
标本采集:

  • 尿液标本采集后24小时内加入Aptima运输管
  • 生殖器和直肠拭子使用Aptima专用采集套装
  • 所有标本在2°C–30°C保存,30天内检测

研究人群:

  • 3个中西部大学人群
  • 2个社区医疗机构(中西部和南部)
  • 3个MSM队列(1个本地,2个全国性)

检测方法:

  1. 商业TMA检测:使用Aptima生殖支原体检测试剂盒
  2. 半定量分析:通过系列稀释确定log10 TMA滴度
  3. MRM-LDT检测:检测A2058/2059位点突变,循环阈值(CT)<40判为阳性

RESULTS
初始发现:

  • 2,145例TMA阳性标本完成MRM-LDT检测
  • 非验证率仅0.17%(4/2414)

核酸载量与耐药相关性:

  • 平均log10 TMA滴度3.46(中位数3,范围0-10)
  • log10滴度≥4的标本MRM检出率87.7%,显著高于≤3标本的29.3%(P<0.0002)

人群差异:

  • MSM和大学生群体平均log10滴度(3.62和3.78)显著高于社区人群(2.79)
  • 大学生症状患者MRM检出率(71.4%)显著高于无症状者(46.7%,P=0.005)
  • 不同MSM队列间MRM率无差异(61.3%-64.9%),但本地MSM滴度低于全国性队列

DISCUSSION
本研究首次系统评估美国不同人群生殖支原体耐药特征:

  1. 总体MRM检出率57.9%,与治疗失败率报道一致
  2. 症状患者更高耐药率提示可能需要差异化治疗策略
  3. 核酸载量作为耐药预测指标需谨慎,因7.3%低载量标本仍检出MRM
  4. 自动化MRM-LDT可在2.5小时内完成检测,支持临床快速决策

局限性包括部分数据来自无症状筛查,与现行CDC指南不一致。未来需探索耐药机制与HIV等STI的流行病学关联。研究为制定人群特异性防控策略提供了重要实验室依据。

ACKNOWLEDGMENTS
感谢Hologic公司提供的技术支持,部分作者曾接受该公司荣誉资助。

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