《藻类降解菌Agarivorans albus S3基因组破译：揭示其利用紫菜(Pyropia yezoensis)多糖的酶系特征》

来自日本佐贺大学的研究团队针对紫菜(Pyropia yezoensis)复杂多糖降解难题，成功分离获得一株以紫菜为营养源的Agarivorans albus S3菌株。通过DNBSEQ-G400RS测序和SPAdes组装技术解析其基因组，发现100余个多糖降解酶基因（包括porphyran、xylan、mannan等水解酶），为海洋多糖资源化利用提供重要菌种资源和理论依据。

　　

紫菜(Pyropia yezoensis)这种可食用海藻堪称"多糖宝库"——细胞间隙富含琼脂糖(porphyran)，细胞壁含有木聚糖(xylan)和甘露聚糖(mannan)，还有作为能量储备的红藻淀粉(floridean starch)。研究人员从海藻养殖场附近(北纬33.196°，东经130.208°)的淤泥中，通过"紫菜粉富集培养法"筛选到一株能高效利用紫菜的细菌，命名为Agarivorans albus S3。

该菌株在含0.5%胰蛋白胨和0.1%酵母提取物的液体培养基中培养后，采用NucleoSpin Microbial DNA试剂盒提取DNA。借助MGIEasy FS建库试剂盒制备测序文库，通过DNBSEQ-G400RS测序仪获得150bp双端读长。经fastp质控和SPAdes组装后，获得5.55Mb的基因组草图，包含4,502个编码基因，GC含量44.7%，基因组完整度高达99.97%。

DFAST分类鉴定结合InterProScan功能注释发现，这个"多糖分解专家"的基因组藏着24个淀粉降解酶基因、18个β-葡聚糖(包括纤维素)水解酶基因，还有专门针对紫菜特征多糖的18个半乳聚糖降解酶(其中11个靶向琼脂糖/porphyran)。更令人惊喜的是，它还携带10个甘露聚糖酶、8个木聚糖酶以及28个底物未知的糖苷水解酶基因，堪称"海洋多糖降解工具包"。

这项研究不仅揭示了A. albus S3利用紫菜的分子机制，更为开发新型海藻生物转化技术提供了珍贵的基因资源。研究获得日本学术振兴会(KAKENHI 19K06188和22K05802)资助，数据分析使用了佐贺大学实验科学分析研究中心的共享计算资源。