全长 Pfs48/45 与强效单克隆抗体复合物的结构解析及其对疟疾传播阻断干预的启示

【字体: 时间:2025年05月23日 来源:Nature Structural & Molecular Biology 12.5

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  推荐 为解决疟疾传播阻断干预难题,研究人员针对疟原虫配子表面蛋白 Pfs48/45 展开研究。通过冷冻电镜解析其与靶向三结构域的人源单克隆抗体复合物结构,发现结构域间构象灵活性,揭示保守表位,为下一代疟疾疫苗设计提供依据。

  

论文解读


疟疾是严重威胁全球公共卫生的重大传染病,2023 年全球约 59.7 万人死于疟疾,其中撒哈拉以南非洲五岁以下儿童占比极高。疟原虫通过蚊子传播的复杂生命周期使其疫苗研发面临巨大挑战,现有疫苗多靶向无性血液阶段或 pre-erythrocytic 阶段,而靶向性阶段抗原以阻断传播的策略(如传播阻断疫苗 TBVs)成为重要补充。Pfs48/45 是疟原虫配子表面关键蛋白,对疟原虫在蚊子中肠发育至关重要,是 TBVs 和单克隆抗体(mAbs)的核心靶点。然而,该蛋白结构不稳定、表位信息有限,尤其是除结构域 3(D3)外的抑制性表位认知不足,严重制约了高效免疫原的设计。

为填补这一空白,加拿大病童医院研究中心(The Hospital for Sick Children Research Institute)等机构的研究人员开展了深入研究。他们通过蛋白质工程构建稳定的全长 Pfs48/45 融合蛋白,结合冷冻电镜(cryo-EM)技术,首次解析了 Pfs48/45 与靶向三个结构域(D1、D2、D3)的人源 mAbs(如 RUPA-58、RUPA-154、TB31F 等)复合物的高分辨率结构,相关成果发表在《Nature Structural & Molecular Biology》。

主要技术方法


研究采用了多项关键技术:①冷冻电镜(cryo-EM):用于解析 Pfs48/45 与 mAbs 复合物的三维结构,通过倾斜样品台收集多视角数据,结合局部精炼获得 3.3? 分辨率的 D1-D2 区域结构;②生物层干涉术(BLI):测定 mAbs 与 Pfs48/45 的结合动力学参数(如 KD 值),验证表位结合特异性;③标准膜饲喂实验(SMFA):评估 mAbs 的传播阻断活性(TRA),计算 IC80 值;④氢 - 氘交换质谱(HDX-MS):定位 mAbs 在 Pfs48/45 上的结合表位,分析构象动态变化;⑤点突变与单核苷酸多态性(SNP)分析:研究 Pfs48/45 表位保守性及突变对 mAbs 结合的影响。

研究结果


  1. Pfs48/45 全长结构与构象动态
    通过 cryo-EM 揭示 Pfs48/45 呈延伸构象,D1 与 D2 通过刚性界面紧密连接,而 D2 与 D3 间通过 5 氨基酸柔性 linker(aa290-294)连接,存在显著构象灵活性(旋转角度达 7°)。不同构象中 D3 位置差异达 40?,提示其在天然状态下可能通过构象变化调控表位暴露。

  2. D1 与 D2 表位的分子特征


  • D1 表位:强效 mAb RUPA-58 靶向 D1 的 loop 区(aa86-115、aa130-140),通过重链互补决定区 3(HCDR3)的酪氨酸残基与 D1 形成广泛相互作用(BSA=975?2)。该表位在疟原虫野外分离株中高度保守,仅 3 个低频 SNP(如 p.N138I)影响结合动力学,但未完全消除活性。
  • D2 表位:RUPA-154 结合 D2 的 β 链(aa212-217、aa271-275 等)及 loop 区(aa226-247),其轻链互补决定区(LCDR1/2)和 HCDR3 介导主要相互作用(BSA=894?2)。尽管结合亲和力高(EC50=0.14μg/ml),但其传播阻断活性中等(IC80=103.1μg/ml),可能与 D3 对表位的空间位阻或天然配体(如 Pfs230)竞争有关。

  1. D3 表位的已知与新见解
    TB31F 等靶向 D3 的 mAbs 通过结合保守表位展现强效 TRA(IC80=0.86μg/ml),结构显示 D3 表面电负性较强,可能与疟原虫细胞膜相互作用相关。研究还发现 D3 稳定突变(如 mAgE2-G397L 等)可显著提升蛋白表达量与折叠效率,为免疫原优化提供关键策略。

  2. 表位保守性与跨物种交叉反应
    D1 表位在恶性疟原虫(Pf)中保守性极高,且部分 mAbs(如 RUPA-71)可交叉结合间日疟原虫(Pv)同源蛋白 Pvs48/45 的 D1D2 区域,提示其在跨物种传播阻断中的潜在价值。


结论与意义


本研究首次系统解析了 Pfs48/45 全长蛋白与多结构域靶向 mAbs 的相互作用机制,揭示了 D1-D2 刚性界面、D2-D3 柔性铰链的结构特征,以及各结构域表位的分子细节与保守性。关键发现包括:①D1 存在强效、保守的构象表位,可作为下一代 TBVs 的核心靶点;②D2 表位活性受构象动态调控,需结合结构优化提升免疫原效力;③Pfs48/45 的柔性特征提示免疫原设计需模拟天然构象动态。这些成果为开发覆盖多表位、高稳定性的疟疾传播阻断干预工具(如多价疫苗、联合 mAb 疗法)提供了直接结构依据,同时为解析疟原虫 - 蚊子互作机制奠定了基础。未来研究可进一步结合天然感染队列的多克隆抗体分析,推动基于结构的免疫原理性设计,加速疟疾消除目标的实现。

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