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单细胞与传统RNA测序揭示癌症相关成纤维细胞在头颈鳞癌中的预后价值及免疫调控机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月24日 来源:Discover Oncology 2.8
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本研究针对头颈鳞状细胞癌(HNSC)微环境中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的异质性及其临床意义展开。研究人员通过整合TCGA数据库的RNA-seq数据与单细胞测序(scRNA-seq),结合ssGSEA、LASSO回归和Cox回归分析,构建了包含ADGRE1、HOXC13等8个基因的CAFs预后模型,发现I型干扰素信号通路和细胞外基质组织是CAFs调控HNSC进展的关键通路。该研究为HNSC的免疫治疗策略提供了新的生物标志物和靶点。
头颈鳞状细胞癌(HNSC)是全球第六大常见恶性肿瘤,尽管手术、放疗等治疗手段不断进步,患者5年生存率仍不足50%。肿瘤微环境(TME)中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)通过分泌细胞因子和重塑细胞外基质,在肿瘤免疫逃逸和转移中起关键作用。然而,CAFs在HNSC中的分子特征和临床价值尚不明确。来自某大学的研究团队通过整合多组学数据,揭示了CAFs调控HNSC进展的新机制,相关成果发表于《Discover Oncology》。
研究采用TCGA HNSC队列的RNA-seq数据和GSE103322单细胞数据集,运用ssGSEA算法量化CAFs活性,通过LASSO回归筛选出8个关键基因(ADGRE1、HOXC13等)构建预后模型。实验验证采用shRNA敲低和CCK-8检测等技术。
单细胞测序分析发现,HNSC组织中存在11种细胞亚群,其中成纤维细胞特异性表达ACTB、B2M等11个标志基因。ssGSEA将患者分为高/低CAFs组,显示高CAFs组具有更强的免疫抑制微环境特征。构建的8基因风险模型能有效预测患者生存(AUC 0.706),高风险组与晚期临床分期显著相关。功能分析揭示I型干扰素信号通路(type I interferon signaling pathway)和细胞外基质组织(extracellular matrix organization)是CAFs调控的核心通路。实验证实ADGRE1敲除可促进HNSC细胞增殖。
该研究首次建立了基于CAFs的HNSC预后预测体系,阐明CAFs通过干扰素通路和免疫检查点分子(如PD-1/CTLA-4)调控肿瘤进展的机制。发现的生物标志物为个体化治疗提供新靶点,模型整合临床参数后预测效能更优(nomogram C-index 0.72)。研究局限性在于缺乏体内实验验证,未来需扩大样本验证模型的临床适用性。
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