《基于基因组学证据的Microbacterium chocolatum与M. aurantiacum分类学修订:异名同种的确证》

【字体: 时间:2025年05月24日 来源:Current Microbiology 2.3

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  来自韩国的研究人员通过16S rRNA基因序列和全基因组分析,重新评估了Microbacterium chocolatum的分类地位。研究发现,M. chocolatum JCM 12412T与M. aurantiacum KACC 20510T的16S rRNA相似度达99.3%,而ANI和dDDH值均超过物种界定阈值(95-96% ANI,70% dDDH),证实三者为同一物种。该研究不仅支持M. kitamiense作为M. aurantiacum异名同种的既往结论,首次提出M. chocolatum也应归并为后者异名,为微生物分类学提供了重要基因组学依据。

  

巧克力微杆菌(Microbacterium chocolatum)的分类地位遭遇基因组学"审判"!通过16S rRNA基因测序和71个细菌单拷贝基因构建的系统发育树显示,M. chocolatum JCM 12412T与其近亲M. aurantiacum KACC 20510T的基因相似度高达99.3%,而M. kitamiense JCM 10270T更是与M. aurantiacum呈现100%的基因双胞胎关系。基因组尺度分析更给出铁证:三者间的平均核苷酸同源性(ANI)和数字DNA-DNA杂交(dDDH)值全部突破物种界定红线(ANI>95-96%,dDDH>70%),在进化树上亲密无间地抱团。这项研究不仅坐实了M. kitamiense作为M. aurantiacum"马甲"的旧案,更揭开了M. chocolatum的"巧克力外衣"——原来它们都是橙黄微杆菌(M. aurantiacum)的异名同种(later heterotypic synonym),为微生物分类名录再添一例基因组学"并案侦查"的成功案例。

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