坦桑尼亚人与牲畜源布鲁氏菌基因组解析：东非地区布鲁氏菌病防控的新分子流行病学证据

来自坦桑尼亚的研究团队针对布鲁氏菌病(Brucellosis)的复杂传播网络问题，通过对Kagera地区人畜共患的六株羊种布鲁氏菌(B. melitensis)进行全基因组测序(WGS)，揭示了该地区菌株与全球流行株的遗传关联。研究采用Illumina平台结合EDGE生物信息学分析，获得高质量基因组组装(完整度>99%)，为东非洲区域防控策略提供关键分子流行病学数据。

　　

在坦桑尼亚Kagera地区，科学家们捕获了六株引发人畜共患病的"隐形杀手"——羊种布鲁氏菌(Brucella melitensis)。这些菌株三株来自山羊乳汁，三株分离自人类患者血液，采样区域正是牛羊混牧的疫病传播热点。

研究团队采用专业级"细菌猎捕"技术：乳汁样本经Farrell氏选择性培养基培养，血液样本通过肝素抗凝管采集，均在5%-10% CO₂条件下培养4天。可疑菌落经过"高温桑拿"(100°C 10分钟)灭活后，用Qiagen试剂盒提取DNA，经IS711基因qPCR验证，最终在Illumina NextSeq 2000平台上完成基因组测序。

生物信息学分析犹如"基因拼图大师"：使用IDBA组装器(参数--maxk 121)拼接基因组，CheckM评估显示组装完整度高达99.45%。有趣的是，这些坦桑尼亚菌株与比利时、科威特甚至挪威的菌株存在"远亲关系"，暗示着跨国传播的可能路径。

基因组数据显示，所有菌株GC含量均为57%，编码密度87%，携带约3125个CDS(编码序列)。特别值得注意的是TZ_Kagera_G01样本，虽然其N50值(23,443 bp)较低，但检出4个rRNA基因，比其他样本多1个"核糖体工厂"。

这些发现如同为东非地区绘制了首份"布鲁氏菌基因地图"，为理解CO₂依赖型病原体的跨物种传播提供了关键线索。美国国防威胁降低局(HDTRA12110039项目)资助的这项研究，最终将助力开发针对性的"分子围栏"防控策略。