首次报道美国蛋鸡斑点肝病病原体——Campylobacter bilis两株分离株的全基因组序列

来自爱荷华州立大学的研究人员针对斑点肝病(SLD)的第二致病菌Campylobacter bilis开展基因组测序研究，首次获得美国商业蛋鸡源C. bilis完整基因组，包含1,461,029 bp和1,461,042 bp双环状染色体，GC含量30.8%，为SLD诊断和致病机制研究提供关键基因组资源。

　　

斑点肝病(SLD)这种由弯曲菌属(Campylobacter)引发的急性传染病，正给养鸡业带来产蛋量骤降和死亡率攀升的双重打击。虽然早在2015年就确认Campylobacter hepaticus是元凶之一，但直到最近科学家们才揪出第二个"真凶"——Campylobacter bilis。

研究人员从美国某商业蛋鸡场的胆汁样本中，捕获了两株被误诊为C. hepaticus的细菌。通过传统PCR和桑格测序(Sanger sequencing)的"身份鉴定"，再结合Illumina MiSeq和纳米孔测序(Nanopore)的"基因画像"，终于让这两株C. bilis现出原形。

基因组拼图游戏玩得相当漂亮：先用Flye v2.9.1进行组装，再用Pilon进行两轮"抛光"，最终获得如同完美圆环的双染色体。这些基因组藏着1,500多个编码序列(CDS)，还标注出抗微生物耐药基因和毒力因子的"危险区域"。

有趣的是，这两株菌与NCBI标准菌株的基因组相似度高达99.98%，就像双胞胎般接近。这些珍贵的基因组数据已经存入GenBank数据库，为后续研制"细菌通缉令"和破解致病密码提供了黄金标准。

整个侦探过程运用了微需氧培养、高通量测序、混合组装等尖端技术，堪称细菌基因组研究的范本。这些发现不仅完善了SLD的致病菌名录，更为开发精准诊断工具点亮了指路明灯。