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DNA增强配体inCu-click实现活细胞内铜催化点击化学反应的低毒性高效标记
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月24日 来源:Nature Communications 14.7
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为解决铜催化叠氮-炔环加成反应(CuAAC)在活细胞内应用时的高铜毒性问题,美国东北大学Sara H. Rouhanifard团队开发了DNA偶联配体BTT-DNA。该技术通过DNA序列定位浓缩铜离子,在无需外源铜盐条件下实现活细胞内新生磷脂和蛋白质的荧光标记,细胞存活率达96%,反应速率提升7.5倍,为活细胞生物分子动态追踪提供了新工具。
在生命科学研究中,实时观测活细胞内生物分子的动态变化一直是重大挑战。铜催化叠氮-炔环加成反应(CuAAC)因其快速反应动力学和小分子探针优势,本是理想工具,但细胞内高浓度铜需求导致的毒性问题长期制约其应用。现有替代方案如无铜点击反应(SPAAC)存在试剂不稳定、商业可得性差等局限,而逆电子需求Diels-Alder反应(IEDDA)则面临四嗪水溶液不稳定的缺陷。如何实现高效低毒的细胞内点击化学标记,成为亟待突破的技术瓶颈。
美国东北大学Sara H. Rouhanifard团队在《Nature Communications》发表的研究中,创新性地开发了inCu-click技术。该技术通过DNA偶联配体BTT-DNA将铜离子定位浓缩在反应位点,在无需添加铜盐条件下实现活细胞内高效标记。研究采用DNA模板驱动的邻近连接技术,结合脂质体递送系统,使铜浓度降低10倍的同时,反应速率提升至商业配体的7.5倍。关键实验技术包括:DNA-配体偶联物的合成与表征、ICP-MS铜离子定量、荧光微孔板读数仪动力学分析、脂质体包裹递送系统、以及多种代谢标记策略(EdU/EU/L-HPG等)。研究团队还建立了完整的细胞毒性评估体系,通过SYTOX绿色染色、Caspase-3/7检测、CellROX氧化应激分析等方法验证生物相容性。
【合成与表征BTT-DNA CuAAC加速配体】
研究发现BTT-DNA配体每个分子可螯合约10个铜离子,经透析纯化后仍保持稳定结合。尿素PAGE电泳和ICP-MS证实,DNA骨架和三唑基团共同参与铜螯合,这种独特结构使配体在冷储存12个月后仍保持活性。值得注意的是,DNA序列组成不影响反应活性,但15-mer长度显示出最佳性能一致性。
【BTT-DNA配体的反应动力学】
使用3-叠氮-7-羟基香豆素和CalFluor 488叠氮两种荧光染料评估显示,100 nM BTT-DNA的反应速率分别达到429.4 s-1M-1和730 s-1M-1,较商业BTTAA配体提升1.4-7.5倍。这种加速效应在500 nM浓度下最为显著,为后续生物应用提供了最佳浓度窗口。
【DNA和RNA模板驱动的邻近连接】
通过设计含1-3个结合位点的DNA/RNA桥接模板,研究实现了荧光信号的级联放大。当使用三重复位模板时,3-叠氮-7-羟基香豆素的荧光强度达到455.1 RFUs,较随机碰撞反应提升1.5倍。这种邻近增强效应在固定细胞中成功应用于M20转基因RNA的单分子检测,信噪比显著提高。
【固定细胞中生物分子的检测】
在EdU标记新生DNA、EU标记RNA、L-HPG标记蛋白质等实验中,20 μM BTT-DNA使信号增强2.2-239.9倍,远超商业配体。特别在磷脂标记中,胆碱代谢物propargyl choline的检测灵敏度达到惊人提升,证实该技术对疏水性生物分子的特殊优势。
【活细胞表面生物分子检测】
细胞表面唾液酸和磷脂的标记实验显示,BTT-DNA在冰上反应30分钟即可实现7.3倍信号增强,且无膜完整性破坏。这种温和条件为细胞表面动态过程研究开辟了新途径。
【BTT-DNA配体的细胞毒性特征】
相较于300 μM游离铜导致的35.5%存活率,BTT-DNA处理组细胞存活率达96%。氧化应激分析表明,该配体将活性氧(ROS)产生从77%降至3.7%,线粒体超氧化物完全消失,证实其卓越的生物相容性。
【活细胞内磷脂和蛋白质检测】
通过脂质体递送系统,研究首次实现活细胞内磷脂代谢的实时追踪,2小时内信号增强2倍。OPP标记的新生蛋白质检测则证实技术可应用于胞质内反应,为蛋白质合成调控研究提供新工具。
这项研究通过巧妙的DNA-配体设计,解决了铜催化点击化学在活细胞应用中的核心矛盾。BTT-DNA不仅将铜用量降低至生理兼容水平,还通过DNA模板效应增强反应效率,其模块化设计更兼容多种递送策略。技术突破使长时间活细胞成像成为可能,为代谢疾病、癌症等研究中生物分子动态追踪提供了变革性工具。未来通过适配不同DNA序列,该平台有望扩展至更多生物系统,推动细胞生物学研究进入更高时空分辨率时代。论文展示的"定位催化"策略也为其他金属催化生物正交反应的设计提供了范式参考。
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