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基于生成式AI设计的口服ENPP1抑制剂ISM5939:靶向cGAS-STING通路的新型实体瘤免疫治疗策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月24日 来源:Nature Communications 14.7
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针对STING直接激动剂存在的生物利用度低和系统性炎症风险等问题,研究人员通过AI驱动的靶点发现平台PandaOmics和生成化学平台Chemistry42,开发出口服ENPP1抑制剂ISM5939。该药物通过稳定肿瘤微环境中的cGAMP,选择性激活抗原呈递细胞的STING通路,在多种实体瘤模型中与PD-1/PD-L1抑制剂和化疗药物展现协同效应,且未引发T细胞凋亡或细胞因子风暴,为克服肿瘤免疫治疗耐药性提供了新策略。
在肿瘤免疫治疗领域,激活STING(Stimulator of interferon genes)通路被认为是增强抗肿瘤免疫的有效策略。然而,现有的STING直接激动剂如ADU-S100和MK-1454面临两大瓶颈:一是需要通过瘤内注射给药,生物利用度差;二是会引发全身性炎症反应和T细胞凋亡,临床获益有限。与此同时,肿瘤微环境(TME)中广泛存在的Ectonucleotide Pyrophosphatase Phosphodiesterase 1(ENPP1)通过降解免疫信使分子cGAMP,抑制了内源性STING通路的激活,成为肿瘤免疫逃逸的关键机制。如何安全有效地靶向这一通路,成为突破当前免疫治疗困境的重要方向。
为解决这一难题,中国的研究团队通过整合人工智能技术和多组学分析,开发出口服ENPP1抑制剂ISM5939。这项发表在《Nature Communications》的研究表明,该药物能特异性抑制ENPP1对cGAMP的水解作用,在多种实体瘤模型中展现出优异的治疗效果和安全性。
研究团队主要运用了四项关键技术:1)基于PandaOmics平台的靶点-适应症关联分析,筛选ENPP1高表达的肿瘤类型;2)通过生成化学平台Chemistry42进行结构优化,获得高选择性抑制剂;3)建立体外酶活性和细胞共培养体系验证药物机制;4)利用小鼠同源肿瘤模型评估单药及联合治疗的疗效。
研究结果部分,首先通过整合分析验证了ENPP1作为多种实体瘤先天免疫检查点的作用。TCGA数据和单细胞测序显示,ENPP1在乳腺癌、胃癌等8种肿瘤中高表达,且与STING-IFN信号呈负相关。空间转录组进一步证实,ENPP1高表达区域呈现"免疫荒漠"特征。
在药物发现环节,研究人员通过AI辅助设计出先导化合物ISM7516(IC50=2.55 nM),经结构优化获得ISM5939。该药物在生理pH下对ENPP1的抑制活性(IC50=0.63 nM)比阳性对照ENPP-IN-1强400倍,且对ENPP2/3的选择性超过15000倍。安全性评估显示,ISM5939不诱导细胞因子释放(与ADU-S100对比),且不影响T细胞活力。
机制研究表明,ISM5939能显著提升dsDNA转染肿瘤细胞的cGAMP分泌量(EC50=0.50 μM),并通过STING-IRF3通路激活THP1细胞的干扰素报告基因。在4T1原位瘤模型中,单次给药即可维持肿瘤内cGAMP和IFN-β水平达48小时,并促进CD8+ T细胞分泌IFN-γ和颗粒酶B。
疗效评估部分尤为突出:在MC38(MSI-H型)模型中,ISM5939联合抗PD-1使M1/M2巨噬细胞比例提高3倍,CD8+/Treg比值增加2倍;在EMT6三阴性乳腺癌模型中,与顺铂联用使肿瘤生长抑制率提高60%,RNA测序显示干扰素反应通路显著激活。值得注意的是,在ENPP1低表达的CT26(MSS型)肿瘤中未观察到显著协同效应,提示ENPP1表达可作为疗效预测标志物。
讨论部分强调,ISM5939的创新性体现在三个方面:一是通过"局部激活"策略避免了STING激动剂的系统性毒性;二是AI平台加速了从靶点验证到临床前候选化合物的转化(仅18个月);三是首次证实ENPP1抑制剂可克服对免疫检查点抑制剂和化疗的双重耐药。研究者特别指出,LRRC8A(cGAMP转运体)的表达可能进一步细化获益人群筛选。目前该药物已获FDA临床试验许可(IND:172399),为实体瘤免疫治疗提供了全新选择。
这项研究的突破在于将AI药物设计、肿瘤免疫学和精准医学有机结合,不仅开发出具有临床转化潜力的候选药物,更揭示了ENPP1-cGAMP-STING轴作为跨瘤种治疗靶点的科学价值。未来研究将聚焦于耐药机制探索和生物标志物开发,以扩大该策略的临床应用范围。
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