基于转录组测序和实验验证的基底细胞癌免疫浸润分析及诊断标志物研究

本研究通过整合GSE7553、GSE103439和GSE42109数据集，结合qPCR与Western blot验证，揭示了基底细胞癌(BCC)中LEF1、LGR5和SOX4作为诊断标志物的潜力，并解析了B细胞、NK细胞等免疫细胞浸润特征，为BCC的早期诊断和免疫治疗提供了新靶点。

　　

基底细胞癌(BCC)作为最常见的皮肤恶性肿瘤，全球发病率持续攀升，其局部侵袭性虽罕见转移却导致严重的组织破坏。尽管 Hedgehog(HH) 通路抑制剂已用于临床，但耐药性和副作用仍是重大挑战。海南医学院附属医院的研究团队在《Discover Oncology》发表论文，通过多组学分析结合实验验证，揭示了BCC免疫微环境特征及新型诊断标志物。

研究团队整合GSE7553、GSE103439和GSE42109三个转录组数据集，筛选出135个差异表达基因(DEGs)，并运用GO/KEGG富集分析、蛋白质互作网络(PPI)构建和免疫细胞浸润评分(ssGSEA)等技术，最终通过qPCR和Western blot验证关键靶点。

3.1 数据预处理与DEG鉴定
PCA分析显示30例BCC与16例对照样本数据质量良好，共鉴定出79个上调基因（如SOX4、LGR5）和56个下调基因（如MYC、JUN），其中上皮细胞增殖和Wnt通路显著富集。

3.4 PPI网络分析
CytoHubba算法筛选出9个枢纽基因，包括LEF1（Wnt通路转录因子）、LGR5（干细胞标记物）和SOX4（表观调控因子），三者均在BCC组织中高表达。

3.6 免疫细胞浸润特征
ssGSEA显示BCC中B细胞、Th1/Th2细胞浸润增加，而树突状细胞(DCs)和调节性T细胞(Tregs)减少，提示免疫激活与逃逸并存。LEF1/SOX4与DCs呈负相关，可能通过抑制抗原呈递促进免疫逃逸。

3.7 诊断模型
ROC曲线证实LEF1(AUC=0.888)、LGR5(AUC=0.955)和SOX4(AUC=0.996)的诊断效能，其中LGR5蛋白表达差异最显著（P<0.05），而SOX4蛋白水平未达统计学意义，可能与样本量或抗体敏感性有关。

讨论与意义
该研究首次系统解析了BCC中LEF1-LGR5-SOX4轴与免疫微环境的互作机制：LEF1通过Wnt/β-catenin通路促进肿瘤增殖，LGR5+癌症干细胞可能分泌TGF-β抑制Treg分化，而SOX4的转录-翻译差异提示其调控复杂性。这些发现不仅为BCC的液体活检提供候选标志物，还为联合免疫检查点抑制剂（如靶向PD-1/PD-L1）的治疗策略奠定理论基础。未来需扩大样本验证SOX4的临床价值，并探索针对LGR5+干细胞的靶向疗法。