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奥希替尼(osimertinib)治疗 EGFR 突变非小细胞肺癌(NSCLC)常因获得性耐药失败,非遗传机制作用关键。本研究通过多组学及 CRISPR 筛选,发现 AP-1 转录因子亚基 FOSL1 和 JUN 驱动耐药,调控 MEK/ERK 通路,抑制 AP-1 可恢复药物敏感性,为逆转耐药提供新策略。
肺癌作为全球癌症相关死亡的主要原因,其中非小细胞肺癌(NSCLC)占比达 85%,EGFR 突变是重要驱动因素。第三代 EGFR 酪氨酸激酶抑制剂(TKI)奥希替尼(osimertinib)虽显著改善患者预后,但长期使用后肿瘤常产生获得性耐药,导致治疗失败。目前,针对奥希替尼耐药的机制尚未完全明确,尤其是非遗传机制(如表观遗传和转录调控)的作用亟待深入探索。在此背景下,来自土耳其伊兹密尔生物医学和基因组中心(Izmir Biomedicine and Genome Center)等机构的研究人员开展了相关研究,旨在揭示奥希替尼耐药的分子机制并寻找潜在治疗靶点。该研究成果发表在《Cell Death and Disease》。
研究人员主要采用了多组学整合分析(包括 ATAC-seq 和 RNA-seq)、CRISPR 功能基因组筛选(靶向表观遗传调控因子和转录因子的 EpiTransNuc gRNA 文库)、细胞功能实验(如克隆形成、侵袭迁移、细胞周期和凋亡分析)以及药物抑制实验等技术方法。同时,通过建立奥希替尼耐药细胞模型(HCC827-OsiR),并结合公共数据库(如 GEO、TCGA)进行分析。
奥希替尼耐药细胞的表型与分子特征
通过逐步药物递增法建立的 HCC827-OsiR 细胞,对奥希替尼的 IC50 显著升高(耐药指数约 3500),并表现出形态改变(如轴突样突起)、上皮 - 间质转化(EMT)特征(E - 钙粘蛋白减少、波形蛋白增加)及侵袭迁移能力增强。分子水平上,EGFR 磷酸化和表达降低,AKT 和 ERK 信号通路代偿性激活,且无 EGFR 靶向突变,表明其耐药主要由非遗传机制驱动。
表观遗传与转录组联合分析
ATAC-seq 和 RNA-seq 分析显示,耐药细胞的染色质可及性与转录组发生显著重编程,两者高度协同。染色质可及性改变区域富集 AP-1 转录因子结合基序,且差异表达基因与 EMT、细胞外基质调控及 RTK 信号通路相关。整合分析表明,表观遗传调控元件(如增强子)的变化驱动了耐药相关基因表达程序,如 FGFR1、AKT3 等基因的上调。
CRISPR 筛选鉴定关键耐药介质
利用 EpiTransNuc 文库筛选发现,AP-1 转录因子亚基 FOSL1 和 JUN 是奥希替尼耐药的关键介质。敲除 FOSL1 或 JUN 可恢复耐药细胞对奥希替尼的敏感性,抑制克隆形成、DNA 合成及侵袭能力,并诱导 G1 期细胞周期阻滞。机制上,AP-1 通过结合染色质可及性改变的顺式调控元件,调控 MEK/ERK 信号轴相关基因表达,维持耐药细胞存活。
AP-1 抑制逆转耐药的验证
药理学抑制 AP-1(如 SR11302)可降低 FOSL1 磷酸化及稳定性,与奥希替尼联用显著抑制耐药细胞生长,抑制 ERK 信号通路,且在多种奥希替尼耐药细胞系(如 PC9-OsiR、H1975-OsiR)中均有效。此外,临床数据显示,FOSL1 高表达与肺癌患者预后不良相关,进一步支持其作为治疗靶点的潜力。
研究结论与意义
本研究通过多组学和功能基因组学方法,揭示了 AP-1 转录因子(FOSL1 和 JUN)在奥希替尼获得性耐药中的关键作用,其通过调控 MEK/ERK 信号通路及 EMT 等耐药相关表型维持肿瘤细胞存活。靶向 AP-1 可逆转耐药,为 EGFR 突变 NSCLC 患者克服奥希替尼耐药提供了新的治疗策略。该发现不仅深化了对非遗传耐药机制的理解,也为开发 AP-1 抑制剂与 EGFR-TKI 联合疗法奠定了基础,有望改善患者临床预后。