综述:机器学习在乳腺癌分子病理学中的作用:基因表达谱和RNA测序应用的综述

【字体: 时间:2025年05月26日 来源:Critical Reviews in Oncology/Hematology 5.5

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  这篇综述系统回顾了人工智能(AI)和机器学习(ML)技术在乳腺癌分子病理学中的应用,重点聚焦基因表达谱(Gene Expression Profiling)和RNA测序(RNA-Seq)两大技术,揭示了AI在诊断(如CNN、SVM模型)、预后(如LASSO回归、Random Forest)及治疗(如miRNA靶点预测)中的突破性潜力,同时指出跨学科合作与大规模临床验证的未来方向。

  

引言

乳腺癌作为女性最高发的恶性肿瘤,其分子异质性和治疗复杂性催生了人工智能(AI)与分子病理学的深度融合。近年来,基因表达谱(Microarray)和RNA测序(RNA-Seq?)技术结合机器学习(ML)算法(如CNN、Random Forest、SVM),显著提升了乳腺癌分子分型、预后评估及个性化治疗的精准度。

方法学进展

通过PubMed、Scopus等数据库的系统检索,研究者筛选出54项关键研究,分为RNA-Seq(24项)和基因表达谱(30项)两大方向。其中,RNA-Seq技术凭借全转录组分析优势,可检测mRNA、lncRNA及miRNA-148a等分子,而基因表达芯片则通过杂交技术靶向分析预设基因。AI模型如DeepSurv(AUROC=0.77)和EOSA-CNN(准确率98.3%)在生存预测和亚型分类中表现突出。

核心发现

诊断应用

  • 随机森林(Random Forest)模型通过 mitochondrial代谢相关基因(如NDUFA9)预测淋巴结转移,准确率达94.5%。
  • 循环miRNA标志物(如miR-16/let-7d)构建的非侵入性筛查工具AUROC达0.85。

预后模型

  • LASSO回归筛选的23基因预后评分(mPS)可跨亚型预测生存期。
  • PANoptosis相关基因签名(如CHMP2B)与肿瘤微环境(TME)免疫浸润显著相关。

治疗优化

  • SVM模型基于hsa-miR-4421预测阿霉素耐药性(AUROC=0.80)。
  • 单细胞RNA-Seq揭示铁死亡(Ferroptosis)激活表型与化疗耐药关联。

挑战与展望

当前局限性包括样本量不足(如5例胶囊挛缩研究)、回顾性数据偏倚及临床转化瓶颈。未来需通过多中心合作验证AI模型,并推动FDA已获批工具(如MammaPrint?)的临床整合。

结论

AI驱动转录组学正重塑乳腺癌诊疗范式,但其全面落地仍需跨学科协作与前瞻性试验支持。从分子机制解码到床旁应用,这一融合领域将持续引领精准肿瘤学发展。

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