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TRIP12结构揭示HECTE3形成K29连接和分支泛素链的机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月27日 来源:Nature Structural & Molecular Biology 12.5
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本文介绍了TRIP12在泛素化修饰中的关键作用,特别是其在形成K29连接和分支泛素链中的机制。通过生化、化学和冷冻电镜技术,研究人员揭示了TRIP12如何特异性地催化这些链的形成,这对于理解细胞信号传导和疾病机制具有重要意义。
论文解读
在细胞的微观世界里,泛素化修饰是一种至关重要的蛋白质翻译后修饰方式,它通过泛素(Ub)分子的共价连接来调控蛋白质的命运。泛素化修饰不仅影响蛋白质的稳定性,还参与细胞信号传导、DNA修复、细胞周期调控等多种生物学过程。然而,泛素化修饰的复杂性和多样性使得对其机制的理解成为一项挑战。特别是非典型泛素链的形成,如K29连接和分支泛素链,其生成机制仍不完全清楚。
为了深入理解这些非典型泛素链的形成机制,来自德国Max Planck Institute of Biochemistry的研究人员对TRIP12进行了详细的研究。TRIP12是一种人类HECT型E3泛素连接酶,它在细胞信号传导和人类健康中起着核心作用。TRIP12不仅能够产生K29连接的泛素链,还能在K48连接的泛素链上形成K29连接的分支。这种多功能性使得TRIP12在多种生物过程中发挥重要作用,包括对氧化应激、脂质应激和pH应激的反应。
为了揭示TRIP12的催化机制,研究人员采用了多种技术手段。首先,他们利用生化方法分析了TRIP12的活性和特异性。通过脉冲追踪实验,研究人员发现TRIP12对K48连接的二聚泛素(di-Ub)具有显著的偏好性,并且能够在其上形成K29连接的分支。其次,研究人员利用化学合成的方法制备了半合成的K48连接的二聚泛素,以测试TRIP12对这些底物的修饰能力。结果表明,TRIP12对K29位置的长度敏感,只有当K29位置的氨基酸侧链长度适中时,TRIP12才能有效地进行修饰。
此外,研究人员还利用冷冻电镜(cryo-EM)技术解析了TRIP12的结构。通过冷冻电镜,研究人员获得了TRIP12在不同状态下的高分辨率结构图像。这些结构显示,TRIP12具有钳子状的结构,一侧由串联的泛素结合域组成,另一侧则是HECT催化域。这种结构使得TRIP12能够特异性地识别和结合K48连接的泛素链,并在其上形成K29连接的分支。
通过这些研究,研究人员得出了一些重要的结论。首先,TRIP12的催化活性依赖于其对K29连接的特异性识别。其次,TRIP12的结构特征决定了其对K48连接的泛素链的偏好性。最后,TRIP12的催化机制与其他HECT型E3泛素连接酶具有相似性,这表明这些酶可能共享一种保守的催化机制。
这些发现对于理解泛素化修饰的多样性和复杂性具有重要意义。TRIP12的多功能性使其在多种生物过程中发挥关键作用,特别是在应对细胞应激反应中。此外,TRIP12的功能异常与神经退行性疾病和自闭症谱系障碍有关,因此,对其催化机制的深入了解有助于揭示这些疾病的发病机制。
总之,这项研究通过生化和结构生物学的方法,揭示了TRIP12在泛素化修饰中的独特作用。TRIP12的结构和功能特性不仅增进了我们对泛素化修饰机制的理解,还为相关疾病的治疗提供了新的思路。这项研究发表在《Nature Structural & Molecular Biology》上,为泛素化修饰领域的研究提供了重要的参考。
TRIP12(TRIP12)是一种重要的E3泛素连接酶,属于HECT(Homologous to the E6-AP Carboxyl Terminus)家族。该家族的成员通过多步骤反应催化泛素的转移,这些反应由HECT域的双叶构象变化介导。首先,HECT域的N叶结合一个E2-Ub中间体,然后泛素的C端被转移到HECT域的C叶。这一过程发生在HECT域的“倒置T”构象中,其中C叶面向N叶结合的E2。在此过程中,HECT E3的C末端氨基酸被认为在多泛素化中起关键作用,但其具体作用尚未完全明了。
在这项研究中,研究人员通过生化分析和结构研究,揭示了TRIP12在催化K29连接和K29/K48分支泛素链形成中的分子机制。研究发现,TRIP12的催化活性依赖于其对K29连接的特异性识别,而其结构特征则决定了其对K48连接的泛素链的偏好性。通过冷冻电镜技术,研究人员获得了TRIP12在不同状态下的高分辨率结构图像,这些结构显示了TRIP12如何特异性地识别和结合K48连接的泛素链,并在其上形成K29连接的分支。
TRIP12的催化机制涉及多个关键步骤。首先,TRIP12的串联泛素结合域识别并结合K48连接的泛素链,将其定位到催化位点。随后,HECT域的C叶将泛素的C端转移到接受泛素的K29位置,形成K29连接。此外,TRIP12的结构特征还允许其在K48连接的泛素链上形成分支,通过与接受泛素的K29位置特异性相互作用,形成K29/K48分支泛素链。
这项研究的发现不仅增进了我们对泛素化修饰机制的理解,还为相关疾病的治疗提供了新的思路。TRIP12的功能异常与神经退行性疾病和自闭症谱系障碍有关,因此,对其催化机制的深入了解有助于揭示这些疾病的发病机制,并为开发新的治疗策略提供依据。通过这项研究,科学家们揭示了TRIP12在泛素化修饰中的独特作用,为未来的研究提供了重要的基础。
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