Genome Medicine：将蛋白质组学纳入罕见病的常规诊断

　　

罕见病是一类发病率低但种类繁多的疾病，给患者及其家庭带来了巨大的身心负担。尽管近年来针对部分罕见病的治疗手段有所突破，但由于缺乏明确的遗传诊断，许多患者仍无法获得个性化的治疗方案。

传统的诊断方法主要依赖于基因组学，然而，基因组学的局限性在于其无法完全解释所有临床表型，尤其是在发现意义不明的变异（VUS）或未发现遗传变异的情况下。因此，寻找新的诊断工具以提高诊断准确性和效率成为当务之急。

近日，费城儿童医院的Elizabeth M. McCormick在《Genome Medicine》上发表评论文章，建议将蛋白质组学纳入罕见病的诊断流程，以缩短诊断时间并扩大治疗选择。

蛋白质组学作为一门新兴的学科，通过对蛋白质的表达水平和修饰状态进行分析，能够提供更为直接的生物学信息。近年来，蛋白质组学在某些罕见病的诊断中展现出了巨大的潜力。

例如，在一项线粒体疾病的研究中，蛋白质组学不仅支持了遗传病因的确认，在某些情况下甚至优于传统的线粒体呼吸链酶分析。这项分析还能协助诊断几名高度怀疑患有线粒体疾病的儿童。

此外，蛋白质组学能够在短时间内提供明确的诊断结果，并且在某些情况下可以指导产前检测和管理决策。例如，在上述研究中，通过对成纤维细胞和外周血单核细胞（PBMC）进行蛋白质组学分析，研究人员成功确诊了多个病例。

值得注意的是，其中一个病例是一名重症婴儿。通过对PBMC进行蛋白质组学分析，临床团队在收到样本54小时内就得到了基因诊断的确认结果，为未来的治疗和管理提供了宝贵的时间窗口。

文章指出，通过将蛋白质组学整合到常规诊断流程中，可以显著缩短诊断时间，提高诊断准确性，并为患者提供更多的治疗选择。此外，蛋白质组学还能够揭示疾病的发病机制和潜在的治疗靶点，为精准医学的发展提供重要的数据支持。

不过，作者也强调了将蛋白质组学整合到常规诊断流程中的挑战。首先，尽管蛋白质组学在诊断中展现了巨大的潜力，但其高昂的成本和技术门槛仍然是限制其广泛应用的主要因素。其次，考虑到研究结果可能很复杂，临床医生可能将研究结果与患者病史和治疗计划相关联，需要对医生进行专门的培训。

最后，考虑到组织特异性的蛋白质表达，必须仔细斟酌哪些组织最适合蛋白质组学分析。作者建议在临床实践中，应根据患者的具体情况选择最合适的组织样本，并在必要时采用分层策略，从最容易获取的组织（如血液）开始。

“罕见病患者的诊断过程可能很漫长，需要花费数年时间，”文章指出。“现在是时候将蛋白质组学工具纳入标准诊断实践，以缩短诊断时间并扩大治疗选择的范围了。”