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工业工作场所洗手设施微生物组与耐药基因分布特征:样本类型与位置对耐药性传播的影响
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月27日 来源:BMC Microbiology 4
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为解决工业环境中抗菌素耐药性(AMR)传播监测不足的问题,研究人员通过宏基因组测序技术(NGS)对比分析了制药工业区洗手池与干手器的微生物组及耐药基因(ARG)分布特征。研究发现干手器与洗手池的微生物群落存在显著差异,而耐药基因谱则主要受采样位置影响。该研究揭示了人类活动对设备耐药组(Resistome)的决定性作用,为AMR环境监测提供了重要数据支撑。
在对抗全球公共卫生危机——抗菌素耐药性(AMR)的战役中,环境传播监测始终是薄弱环节。工业场所的洗手设施作为高频接触区域,其微生物生态与耐药基因传播风险长期缺乏系统研究。尤其令人担忧的是,干手器产生的气溶胶可能成为耐药菌扩散的"隐形高速路",但现有研究多集中于医院环境,对制药厂等特殊工业场景的关注几乎空白。
英国Randox Laboratories的T.P.Thompson团队在《BMC Microbiology》发表的研究,首次通过宏基因组学揭示了工业洗手设施的微生物地理学特征。研究人员采集制药厂三类区域(毗邻"湿实验室"的卫生间、工程与制造部门)的干手器(HD)与洗手池(S)配对样本,利用Illumina NovaSeq-6000进行高通量测序,结合CARD数据库的耐药基因(RGI)分析,绘制了工业环境AMR传播的微观图谱。
主要技术方法
研究采用peel-pouch拭子采集6组配对样本,通过MagMax Microbiome Ultra试剂盒提取DNA,Illumina DNA Prep建库后使用SPAdes v3.14.0进行宏基因组组装。耐药基因注释采用RGI v6.0.2与CARD数据库,微生物分类通过Kraken v2.0.8完成。利用Metabat2 v2.2.15生成宏基因组组装基因组(MAGs),CheckM v1.1.3评估质量(完整性>50%,污染<5%)。统计采用PERMANOVA分析β多样性差异。
微生物群落的空间密码
通过PCoA分析发现,干手器与洗手池的微生物组在科水平存在显著分离(Bray-Curtis p=0.002)。令人意外的是,相距仅1米的配对设施微生物相似性,远低于不同楼层的同类设备。例如,干手器HDA中伯克霍尔德菌科(Burkholderiaceae)占比高达96.04%,而相邻洗手池SA则以假单胞菌科(Pseudomonadaceae)为主。这种"生态位优先"现象提示设备微环境(温度、气流等)比物理距离更能塑造微生物群落。
耐药基因的地理印记
与微生物组相反,耐药基因谱呈现明显的"区位特异性"。工程制造区(E&M)干手器的ARG数量显著高于实验室区(p=0.0395),且氟喹诺酮类耐药基因(n=496)占比最高。宏基因组分析发现,伯克霍尔德菌科MAGs平均携带15.67个ARG,但63%的MAGs无法准确分类至科以下水平,暗示工业环境存在大量未表征的耐药菌株。
人类活动的生物标志物
研究揭示耐药组差异主要源于使用群体差异:实验室人员频繁使用乙醇消毒,其接触区域ARG丰度降低;而工程部门设备则检出更多消毒剂耐药基因(qacE)。这种"人员-微生物"关联性为AMR传播溯源提供了新思路。
该研究开创性地证实:工业洗手设施的微生物组由设备类型定义,而耐药组则由人类活动塑造。这一发现挑战了传统"距离决定论",为AMR环境监测提供了关键科学依据。特别值得注意的是,研究揭示制药厂干手器可能成为耐药菌"放大器",这对工业卫生标准修订具有直接指导意义。随着宏基因组技术的普及,此类环境哨点监测有望成为遏制AMR传播的前沿阵地。
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