利用ATR-FTIR光谱技术结合机器学习诊断COVID-19:冻干鼻拭子样本的创新应用

【字体: 时间:2025年05月27日 来源:Biophysical Chemistry 3.3

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  推荐 为解决传统COVID-19检测方法(如RT-PCR)成本高、依赖专业人员及基础设施的问题,研究人员采用ATR-FTIR光谱技术结合机器学习,对冻干鼻拭子样本进行分析。结果显示,该方法可100%准确区分健康与感染样本,具有快速、无创且高通量的优势,为后疫情时代的筛查提供了新工具。

  

论文解读
自2019年底新冠病毒(SARS-CoV-2)暴发以来,全球公共卫生体系面临前所未有的挑战。快速、准确的诊断技术成为遏制病毒传播的关键。然而,传统的逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测依赖专业实验室设备与技术人员,且耗时较长,难以满足大规模筛查需求。此外,无症状感染者占比高达50%,进一步加剧了防控难度。在此背景下,科学家亟需开发一种无创、高效且低成本的检测方法。

为此,巴基斯坦国立卫生研究院(National Institute of Health, NIH)的研究团队创新性地采用衰减全反射傅里叶变换红外光谱(Attenuated Total Reflection-Fourier Transform Infrared Spectroscopy, ATR-FTIR)技术,结合机器学习算法,对冻干鼻拭子样本进行分析。该研究通过对比55例COVID-19阳性患者与55例健康个体的样本,揭示了光谱特征在疾病诊断中的潜力。

研究团队首先对样本进行预处理,去除水分干扰后,获取600–4000 cm-1波数范围内的平均光谱。分析发现,COVID-19阳性样本与健康样本在17个波数位置存在显著差异,其中13个峰值仅出现在阳性样本中。随后,研究人员通过主成分分析(Principal Component Analysis, PCA)、线性判别分析(Linear Discriminant Analysis, LDA)和支持向量机(Support Vector Machine, SVM)进行分类验证。结果显示,LDA模型的二次核函数实现了100%的分类准确率,而SVM模型在内外部验证中均保持同样性能。

关键技术方法
研究团队采用ATR-FTIR光谱技术获取样本的红外吸收特征,并结合PCA、LDA及SVM算法进行数据分析。样本经冻干处理以提高信噪比,并通过预处理消除水分干扰。

研究结果与结论
研究发现,COVID-19阳性样本的光谱在特定波数处呈现显著差异,这些差异可能与病毒引发的生化变化相关。LDA与SVM模型的分类结果表明,该方法具有极高的敏感性与特异性。研究团队指出,冻干鼻拭子样本不仅简化了传统检测流程,还降低了成本,适用于资源有限地区的快速筛查。

该研究的意义在于提出了一种无创、高通量的COVID-19诊断替代方案。相较于RT-PCR,ATR-FTIR技术无需复杂设备,且检测时间大幅缩短。此外,冻干样本的稳定性为长期存储与运输提供了便利,尤其适用于偏远地区或应急场景。尽管如此,研究团队也强调需进一步验证不同变异株的适用性,并探索更多生物标志物以提高诊断特异性。

总体而言,这项研究为COVID-19诊断开辟了新方向,其成果有望推动低成本、高效率检测技术的普及,助力全球抗疫工作。论文发表于《Biophysical Chemistry》,为光谱技术在医学诊断中的应用提供了重要参考。

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