优化cfDNA中克隆性免疫球蛋白重排检测的前处理和分析条件研究

推荐 为解决循环肿瘤DNA（cfDNA）中克隆性免疫球蛋白（cIg）序列检测效率低的问题，研究人员评估了cfDNA提取方法（磁珠法 vs 离心柱法）及NGS文库制备流程对IGH测序的影响。结果表明，磁珠法提升cfDNA回收率，优化后的双重文库纯化显著提高短/中等长度靶标读长深度，助力淋巴瘤疾病状态精准识别。

　　

翻译
背景
循环肿瘤DNA（circulating tumor DNA, cfDNA）作为癌症患者的诊断、预测和预后标志物具有重要价值。在淋巴瘤患者中，克隆性免疫球蛋白（clonal immunoglobulin, cIg）序列能够精准识别疾病状态。然而，目前关于影响cfDNA中cIg检测的前处理和分析条件的研究较少。本研究评估了cfDNA提取及下一代测序（next-generation sequencing, NGS）文库制备对IGH测序的影响。

方法
分析来自健康供体的混合血浆以及参与横断面研究的患者血浆（N=118）。比较两种cfDNA提取方法（磁珠法和离心柱法），并设置不同血浆体积；评估两种NGS文库制备流程（单次和双重纯化），并设置不同cfDNA起始量。

结果
磁珠法提取的cfDNA回收率显著高于离心柱法。更高纯度的cfDNA使cIg序列检测更稳定。NGS文库条件影响IGH测序的读长深度、多样性及完整免疫球蛋白序列的富集度。改进的双重文库纯化流程在不依赖cfDNA起始量的情况下，提高了短/中等长度靶标的读长深度。

结论
本研究首次系统评估了影响cfDNA中免疫球蛋白测序的前处理和分析因素。结果表明，优化的cfDNA提取及文库制备流程可显著提升克隆性免疫球蛋白重排的检测效率。