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CHOL、HNSC、ESCA 和 LIHC 等恶性肿瘤缺乏可靠生物标志物。研究人员基于 TCGA 数据，借助多平台分析 COPS4 在上述癌症中的作用，发现其高表达与临床参数相关，且与免疫细胞浸润有关，为癌症诊疗提供新方向。
癌症如同潜伏在人类健康领域的 “杀手”，其复杂性与高致死率一直是医学研究的重大挑战。在全球范围内，像胆管癌（CHOL）、头颈部鳞状细胞癌（HNSC）、食管癌（ESCA）和肝细胞癌（LIHC）等恶性肿瘤，不仅恶性程度极高，还缺乏能够用于早期检测、预后判断和治疗靶向的可靠生物标志物。传统的诊疗手段在面对这些 “狡猾” 的肿瘤时，常常显得力不从心，无法精准地 “锁定” 肿瘤的发展轨迹，这就导致很多患者错过了最佳的治疗时机，使得癌症的死亡率居高不下。因此，寻找新的生物标志物和治疗靶点，成为了医学界迫切需要解决的问题。
为了攻克这一难题，来自相关研究机构的研究人员开展了关于 COPS4 蛋白在上述几种癌症中作用的研究。该研究成果发表在《Computers in Biology and Medicine》上。研究人员通过一系列严谨的科学探究，得出了重要结论，为这些恶性肿瘤的诊疗带来了新的希望。
研究人员主要运用了多种生物信息学分析平台和技术方法来开展研究。基于 TCGA（癌症基因组图谱）数据集，整合了 UALCAN、GEPIA、MEXPRESS、OncoDB、UCSC Xena、ENCORI、TIMER、GeneMANIA、TNMplot 和 TISIDB 等分析平台，对 COPS4 在 CHOL、HNSC、ESCA 和 LIHC 中的转录图谱、基因组畸变、免疫关联及潜在功能进行了分析。同时，还进行了虚拟筛选和分子动力学模拟，以探索其药物开发潜力。此外，通过免疫组织化学（IHC）分析对肿瘤标本中的蛋白水平进行了验证。
计算机模拟 COPS4 表达分析
研究人员利用 UALCAN、GEPIA、OncoDB、ENCORI 和 TNM Plot 等数据库，对 COPS4 在 CHOL、ESCA、HNSC 和 LIHC 不同分子亚型、阶段、等级以及淋巴结受累和转移阶段的表达进行了计算机模拟分析。
COPS4 在 CHOL 中的过表达
通过 UALCAN 分析发现，CHOL 原发肿瘤样本中的 COPS4 表达显著高于正常样本，这一结果也得到了 OncoDB 和 ENCORI 数据库的验证。基于淋巴结转移状态的 UALCAN 分析显示，N0 和 N + 状态下 COPS4 表达增加。
讨论与结论
癌症的发展涉及大量分子和组织水平的转变。通过研究与癌症相关的生物分子，如核酸、蛋白质等，研究人员可以发现有价值的临床生物标志物。本研究表明，COPS4 在 CHOL、ESCA、HNSC 和 LIHC 的不同阶段、等级和转移状态中显著上调。COPS4 表达升高和基因改变与预后较差相关，IHC 证实 CHOL、ESCA 和 LIHC 肿瘤组织中的蛋白水平较高。体细胞拷贝数变异与免疫细胞浸润密切相关，包括 CD8+/CD4+T 细胞、B 细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞。COPS4 表达还与癌基因子集呈正相关，与肿瘤抑制因子呈负相关，NUP54 和 HELQ 是一致的共靶点。启动子低甲基化和基因扩增是其过表达的机制。虚拟筛选和分子动力学模拟确定了与 COPS4 相互作用的 FDA 批准药物，强调了其致癌作用和治疗潜力。
这项研究深入揭示了 COPS4 在多种恶性肿瘤中的重要作用，为这些癌症的早期诊断、预后评估和治疗提供了新的生物标志物和治疗靶点，为癌症的精准医疗开辟了新的道路。它不仅丰富了我们对癌症发生发展机制的认识，也为后续的临床研究和靶向治疗药物开发奠定了坚实的基础，有望在未来显著改善癌症患者的治疗效果和生存质量。
