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利用多H3N2变异株疫苗接种前抗体滴度预测接种后免疫应答的前瞻性研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月27日 来源:eBioMedicine
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针对流感疫苗个体应答差异大、预测模型缺乏的难题,研究人员整合15项H3N2疫苗研究数据(1997-2021年),开发了基于机器学习的前瞻性预测模型。该模型通过疫苗接种前HAI(血凝抑制)滴度、历史变异株反应等特征,实现接种后抗体应答2.4倍误差的精准预测(优于零模型3.2倍),并在2022-2023年四项新研究中验证有效性。该成果为个性化疫苗策略提供新工具,尤其有助于识别低应答人群。
流感疫苗的免疫保护效果长期受限于个体应答的高度异质性——即便疫苗株与流行株匹配,人群保护率仍仅20-50%,且部分个体几乎不产生应答。传统“病毒中心”策略依赖疫苗株匹配度,但无法预测个体免疫反应差异。更棘手的是,现有模型多基于单季节数据,跨季节预测性能骤降(如Parvandeh等模型R2从0.63降至0.26-0.36)。这些瓶颈促使研究者思考:能否通过系统分析历史免疫印记,建立普适性预测框架?
针对这一挑战,来自美国拉霍亚免疫研究所(La Jolla Institute for Immunology)等机构的研究团队创新性地整合了15项跨越24年(1997-2021)的H3N2疫苗研究数据,涵盖20,000个数据点。他们开发了基于随机森林的机器学习模型,首次证明疫苗接种前对多变异株的HAI滴度可精准预测接种后应答,误差仅2.4倍(95% CI: 2.34-2.40x),显著优于零模型(3.2倍)。该成果发表于《eBioMedicine》,为流感疫苗的精准化应用提供了重要工具。
研究采用三大关键技术:1)多中心队列整合(15项历史研究+4项新研究,含美国乔治亚州和加利福尼亚州人群);2)血凝抑制试验(HAI)标准化分析(log10转换处理滴度数据,控制2倍实验误差);3)机器学习建模(基于预接种HAI滴度矩阵,采用行中心化随机森林算法预测接种后反应)。
研究结果揭示:
免疫应答的时空规律:分析15项研究2,441份血清发现,接种后几何平均滴度(GMT)为95,但个体差异显著。连续季节接种显示73%人群维持高/低应答惯性(高→高82%,低→低57%),疫苗株未变时惯性达83%。
预测特征权重分析:通过110,000对跨研究样本匹配发现,预接种HAI对疫苗株(VacPre)和变异株(RMSE=4.0x)的预测贡献最大,显著优于人口学特征(年龄RMSE=5.9x)。地理区位、年龄等仅提供边际增益。
跨季节预测验证:模型在2017 UGA队列中预测变异株A/Uruguay/716/2007的RMSE仅2.3倍(接近HAI实验误差)。对2022-2023年四项新研究(含Fluzone、Afluria、FluMist三种疫苗)的盲法预测显示,灭活疫苗RMSE=2.35x,减毒疫苗适用零模型(RMSE=1.6x)。
关键生物标志物发现:预接种HAI峰间隔(ΔPeak)可区分强/弱应答(2-3年间隔73%为强应答,4-6年73%为弱应答),优于年龄或基线滴度等传统指标。
这项研究开创性地证明,个体免疫历史(通过多变异株HAI谱)比疫苗株本身更能决定应答强度。其重要意义在于:1)提供可操作的预测工具,通过预接种检测识别低应答者;2)揭示免疫印记的动态规律(ΔPeak),为疫苗设计提供新靶标;3)建立跨季节预测框架,突破传统模型时效性局限。值得注意的是,尽管高剂量疫苗、不同灭活制剂等干预未能显著改变应答模式,但模型成功捕捉到这些“无效差异”,暗示流感疫苗群体保护背后存在更基础的免疫规律。
该研究的局限在于仅聚焦H3N2亚型(因半数数据集未测其他亚型),且减毒疫苗的血清学预测仍需改进。未来方向包括扩展至H1N1/B型流感,并探索与细胞免疫的关联。这些发现不仅推动流感疫苗从“一刀切”到个性化策略的转变,其方法论对其它快速变异病原体(如SARS-CoV-2)的疫苗研发也具有启示意义。
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