印度西孟加拉邦PTGS2 rs689466多态性与哮喘关联的功能性研究及其在基因治疗中的潜在价值

【字体: 时间:2025年05月27日 来源:Gene 2.6

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  本研究针对印度西孟加拉邦花粉诱导性哮喘患者,首次探讨了PTGS2基因rs689466多态性的功能性影响。通过PCR-RFLP基因分型、转录因子结合预测(SNP2TFBS)、蛋白质-DNA互作分析(HDOCK/DNAproDB)及qPCR/Western blot验证,发现GG/AG基因型通过改变启动子区转录因子结合能力,显著降低PTGS2表达,进而加重患者肺功能指标(FEV1/FVC)异常。该研究为印度人群哮喘的基因靶向治疗提供了新依据,发表于《Gene》。

  

哮喘作为全球高发的慢性呼吸道疾病,在印度呈现出惊人的疾病负担——占全球哮喘死亡人数的42%,其中花粉是重要诱因。这种疾病的本质是气道炎症与支气管收缩的恶性循环,而前列腺素E2(PGE2)等炎症介质通过环氧合酶-2(COX-2,由PTGS2基因编码)途径的异常激活在其中扮演关键角色。尽管已有研究提示PTGS2基因多态性可能影响哮喘易感性,但针对印度人群——特别是环境暴露特征明显的西孟加拉邦地区——的相关研究仍属空白。

为填补这一空白,位于西孟加拉邦的过敏与哮喘研究中心团队开展了一项开创性研究。他们聚焦PTGS2基因启动子区的rs689466单核苷酸多态性(SNP),通过病例对照设计(155例花粉诱导性哮喘患者vs 155例健康对照),结合计算生物学与分子实验技术,首次揭示了该位点通过调控COX-2表达影响印度人群哮喘表型的分子机制。

研究采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)进行基因分型,通过SNP2TFBS预测转录因子结合变化,利用HDOCK进行蛋白质-DNA分子对接模拟,并借助DNAproDB分析互作界面。定量PCR(qPCR)和蛋白质印迹(Western blot)分别检测mRNA和蛋白表达水平。

结果部分显示:

  1. 基因型分布差异:患者组GG/AG基因型频率显著高于对照组(P=0.02/0.04),风险等位基因G携带者哮喘发生率增加。
  2. 肺功能关联:不同基因型患者FEV1/FVC比值存在极显著差异(P<0.0001),GG/AG基因型患者肺功能损伤更严重。
  3. 分子机制:rs689466变异导致启动子区转录因子(如NF-κB)结合能力改变,AA基因型患者PTGS2 mRNA表达上调,而GG/AG基因型表达受抑制,相应蛋白水平也呈现相同趋势。

结论与讨论
该研究首次证实PTGS2 rs689466多态性是印度西孟加拉邦人群花粉诱导性哮喘的重要遗传标记。风险等位基因G通过削弱转录因子与启动子的结合效率,导致COX-2表达下降,进而可能影响前列腺素稳态,加剧气道炎症反应。这一发现为开发针对PTGS2基因的靶向治疗策略(如基因编辑或转录因子调控)提供了理论依据,对实现印度高发区哮喘的精准防控具有重要价值。研究团队特别指出,未来需扩大样本量以验证该位点在不同环境暴露亚群中的效应差异,并探索其与现有抗炎药物的协同作用机制。

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