2024年孟加拉国基孔肯雅病毒(Chikungunya virus, CHIKV)再度暴发：流行病学特征、基因组变异与公共卫生警示

本研究针对2024年孟加拉国达卡地区基孔肯雅病毒(CHIKV)再度暴发事件，通过流行病学调查、RT-PCR检测及E1基因测序技术，揭示该病毒ECSA基因型新亚系的传播特征。研究发现35%确诊率、81%患者存在28天持续症状，并鉴定出关键E1-K211E突变，为热带地区虫媒病毒防控提供重要科学依据。

　　

基孔肯雅病毒(CHIKV)作为一种由伊蚊传播的甲病毒属病原体，自1950年代首次发现以来，已在全球100多个国家引发周期性流行。2004年肯尼亚暴发后，该病毒通过E1-A226V突变获得对白纹伊蚊(Aedes albopictus)的适应性，导致传播能力显著增强。孟加拉国自2008年报告首例病例后，2017年曾经历大规模流行，累计确诊13,176例。然而2024年，在登革热疫情持续肆虐的背景下，该国达卡地区突然再现CHIKV感染病例，这对本已不堪重负的医疗系统构成双重威胁。

为阐明此次暴发的流行病学特征和病毒进化规律，孟加拉国流行病学疾病控制研究所(IEDCR)的研究团队开展了系统研究。通过对394例疑似病例的检测，确认138例阳性感染(35%)，其中98.6%集中在达卡城区。研究采用实时逆转录PCR(RT-PCR)技术进行病原诊断，并运用牛津纳米孔测序技术对12份高病毒载量样本的E1基因进行全长测序。

流行病学特征方面，确诊病例呈现明显性别(64.5%男性)和年龄(83.3%≥30岁)差异。所有患者均出现发热，97.8%伴关节痛，83.2%存在肌痛。值得注意的是，14.5%患者需住院治疗(平均5.9天)，81%的随访患者在28天后仍报告持续性症状，主要体现为关节疼痛(96%)和疲劳(29.4%)。统计分析显示，初始症状超过4种(IRR:1.19)和合并心代谢疾病(IRR:1.28)是预后不良的独立风险因素。

基因组分析获得27,195条高质量测序 reads，覆盖深度413-1250×。12株病毒E1基因序列显示>99%核苷酸同源性，均属于东-中-南非(ECSA)基因型。与参考株NC_004162相比，存在D284E、I55V、K211E等特征性突变。值得注意的是，这些毒株缺乏经典的E1-A226V适应性突变，但携带E1-K211E替代——该突变最早发现于2016年印度流行株，可增强病毒在埃及伊蚊(Aedes aegypti)中的复制效率。系统发育分析表明，2024年毒株形成独立进化支，其最近共同祖先可追溯至2019年当地流行株，提示此次暴发源于本土病毒株的持续进化而非新输入。

讨论部分强调，在孟加拉国城市化进程加速、气候条件适宜蚊媒繁殖的背景下，CHIKV再现具有重大公共卫生意义。研究首次证实E1-K211E突变株在孟加拉国的持续传播能力，其基本繁殖数(R₀)可能接近2017年记录的4.2水平。尽管未发现CHIKV与登革病毒(DENV)共感染病例，但两种病毒症状重叠可能造成误诊。作者建议加强病媒综合防控和哨点监测，以应对2025-2026年可能出现的更大规模流行。

该研究发表于《IJID Regions》，为热带地区虫媒病毒防控提供了重要科学依据。通过整合流行病学调查与基因组监测技术，不仅揭示了CHIKV的进化动态，也为开发针对性防控策略奠定了理论基础。特别是对E1蛋白关键突变的功能解析，为理解病毒适应性进化提供了新的分子视角。