哈瑞普尔地区人群伤寒、结核和霍乱的遗传风险分析：IL1β基因多态性与疾病易感性的整合研究

为解决巴基斯坦哈瑞普尔地区结核、伤寒和霍乱的高发问题，研究人员通过整合基因组分析方法，聚焦IL1β基因rs1143627和rs1143629多态性，揭示其在南亚人群中的高频分布（rs1143627:0.401243%；rs1143629:0.388812%），并通过ARMS-PCR验证本地人群的等位基因频率（0.1128%和0.18%）。该研究为区域性疾病防控提供了遗传学依据，发表于《Infection, Genetics and Evolution》。

　　

在21世纪公共卫生取得显著进展的背景下，结核病、伤寒和霍乱仍是全球健康的重要威胁，尤其在低收入地区。这些疾病的持续流行与遗传因素密切相关，但针对特定人群的遗传风险分析仍存在空白。巴基斯坦哈瑞普尔地区作为结核病和伤寒的高发区，其遗传背景与疾病易感性的关联亟待探索。

哈瑞普尔大学的研究团队开展了整合遗传风险分析，聚焦IL1β基因的rs1143627和rs1143629多态性。通过检索公共数据库（如gnomAD v3、Genome Asia 100k）和本地样本验证，发现这两个位点在南亚人群中呈现高频分布，并与疾病易感性显著相关。研究采用ARMS-PCR技术对50例本地样本进行基因分型，结合Hardy-Weinberg平衡分析，揭示了IL1β变异在区域性疾病防控中的潜在价值。论文发表于《Infection, Genetics and Evolution》。

关键技术包括：1) 多数据库联合分析（涵盖11个种族群体）；2) 四引物扩增受阻突变系统PCR(ARMS-PCR)检测SNP；3) 哈迪-温伯格平衡计算等位基因频率；4) 本地人群样本采集（哈瑞普尔地区50例）。

研究结果：

1. 遗传变异的多效性关联：发现IL1β、TLR10等5个基因的7个SNP在结核、伤寒和霍乱中具有重叠关联，其中IL1β rs1143629同时关联结核和霍乱，rs1143627关联结核和伤寒。
2. 全球人群等位基因频率差异：南亚人群rs1143627频率最高（0.401243%），显著高于非洲（0.365384%）和欧洲（0.6571%）人群。
3. 本地验证结果：哈瑞普尔人群中rs1143627突变型频率为0.1128%，rs1143629为0.18%，低于南亚平均水平但呈现明确遗传风险梯度。

结论与意义：
该研究首次系统描绘了哈瑞普尔地区传染病的遗传风险图谱，证实IL1β基因多态性在疾病易感性中的关键作用。尽管样本量限制可能影响统计效力，但通过整合公共数据库与本地验证的策略，为资源有限地区的精准防控提供了可行方案。未来需扩大样本量并探索IL-1β（白细胞介素-1β）在炎症通路中的调控机制，以开发针对高风险人群的干预措施。研究结果对理解南亚人群的遗传-环境交互作用具有重要启示，也为全球传染病遗传学研究补充了区域数据。