
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
基于机器学习的人源iPSC心肌细胞钙瞬变信号分析揭示Brugada综合征药物反应及表型差异
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月27日 来源:Informatics in Medicine Unlocked CS9.5
编辑推荐:
本研究通过机器学习方法分析人源诱导多能干细胞(iPSC)分化的心肌细胞(iPSC-CMs)钙瞬变(Ca2+)信号,成功区分了携带SCN5A基因突变的Brugada综合征(BrS)患者与无症状携带者的药物反应差异。研究采用肾上腺素和抗心律失常药氟卡尼(flecainide)处理细胞,利用14种峰值特征构建分类模型,最高准确率达93%。该成果为遗传性心律失常的精准药物筛选提供了AI驱动的创新方法,首次实现从钙信号层面区分临床表型差异。
论文解读
心脏疾病的精准医疗一直面临重大挑战——如何预测药物对携带相同基因突变但临床表现迥异个体的效果?Brugada综合征(BrS)便是典型例子,这种由SCN5A基因突变引发的致死性心律失常疾病,约30%携带者终身无症状,但突发心源性猝死风险极高。传统电生理检测难以捕捉细微差异,而临床常用的氟卡尼激发试验又存在风险。这促使研究者将目光投向人类诱导多能干细胞(iPSC)技术——通过将患者体细胞重编程为具有个体基因特征的心肌细胞(iPSC-CMs),在培养皿中重建"患者特异性"疾病模型。
来自芬兰坦佩雷大学等机构的研究团队开创性地将机器学习(ML)与钙成像技术结合,对来自症状性和无症状性SCN5A突变携带者的iPSC-CMs进行系统分析。研究通过肾上腺素模拟心律失常状态,再用钠通道阻滞剂氟卡尼诱发BrS表型,记录钙瞬变信号动态变化。相关成果发表于《Informatics in Medicine Unlocked》,为遗传性心脏病药物反应预测提供了AI新范式。
研究采用三大关键技术:1)基于峰值检测算法提取钙信号14维特征(包括振幅、导数极值等);2)留一信号交叉验证(LOSDO)的机器学习框架;3)支持向量机(SVM)、随机森林等多算法比较。样本来自2例BrS患者(1例有症状/1例无症状)和2例健康对照的iPSC-CMs。
结果分析
1. 药物反应分类
通过比较肾上腺素处理后的异常信号与氟卡尼处理后的正常/异常信号,SVM-RBF模型对症状性细胞系的分类准确率达82%。特征重要性分析显示,第一导数极值(峰值左右斜率)是区分药物响应的关键指标。图2展示的规整峰值与图3的双峰异常形成鲜明对比,印证了算法对药物作用模式的捕捉能力。
2. 基线信号差异
无症状细胞系(13,901)与症状性细胞系(14,004)的基线信号分类准确率达71%,氟卡尼处理后升至88%。图6-11显示症状性细胞的基线信号更易出现不规则峰间距和振幅波动,提示钙处理(Ca2+ handling)固有差异可能是表型分化的生物标志物。
3. 患者-对照区分
健康对照(04511/04602)与突变细胞系的基线信号分类准确率最高达97%。图12-15显示正常细胞的钙瞬变呈现更稳定的振荡模式,而突变细胞即使未用药也表现出更明显的电生理不稳定特征。
4. 表型特异性识别
最具临床价值的发现是:机器学习能区分同源突变但表型迥异的细胞系(准确率71-88%)。这种差异在传统电生理研究中难以检测,但通过钙信号动态的AI解析得以实现。
结论与展望
该研究首次证明:1)钙瞬变信号的机器学习分析可量化评估抗心律失常药效;2)无症状与症状性突变携带者的iPSC-CMs存在可检测的钙处理差异;3)AI方法灵敏度超越常规电生理检测。这为遗传性心律失常的精准分型提供了新思路——未来或可通过"数字药物试验"预测患者用药风险。
研究局限性在于样本量较小,但创新性地将衍生心脏类器官技术与人工智能结合。随着深度学习在时序信号分析中的应用深化,这种"干湿结合"策略有望推动个体化医疗从概念走向临床实践,特别是为基因诊断明确但表型不确定的患者提供决策支持。
生物通微信公众号
知名企业招聘