从危机到常规:通过科学疫情网络中强化的 EQA 计划实现 SARS-CoV-2 基因组检测的标准化

【字体: 时间:2025年05月27日 来源:International Journal of Medical Microbiology 4.5

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  为应对 COVID-19 疫情中 SARS-CoV-2 基因组检测方法可靠性存疑的问题,研究人员开展了 SARS-CoV-2 检测外部质量评估(EQA)计划研究。通过多轮 EQA 发现检测阳性率达 95.8%-99.7%,阴性率达 95.1%-99.4%,该研究为新兴病原体诊断质量评估提供了参考。

  在全球抗击 COVID-19 的征程中,病毒检测的准确性和可靠性始终是疫情防控的关键环节。疫情初期,快速涌现的多种 SARS-CoV-2 基因组检测方法(包括实验室自建方法 LDTs 和商业试剂盒)在性能和可靠性上存在显著差异,不同实验室的检测结果缺乏统一的质量评估标准,这不仅影响了临床诊断的准确性,也为疫情监测和防控带来了挑战。如何快速建立有效的质量控制体系,确保检测方法的准确性,成为全球公共卫生领域亟待解决的问题。
为了规范 SARS-CoV-2 基因组检测流程,提升检测质量,德国 INSTAND 协会联合多国研究机构开展了一系列研究。研究团队围绕 SARS-CoV-2 检测的敏感性、特异性及不同检测系统的性能差异等核心问题,构建了强化的外部质量评估(EQA)体系,并在 2020 年 4 月至 2023 年 6 月期间实施了 13 轮 EQA 计划,累计有来自 49 个国家的 1413 个实验室参与。该研究成果发表在《International Journal of Medical Microbiology》,为全球 SARS-CoV-2 检测的标准化提供了重要的科学依据。

研究人员主要采用了以下关键技术方法:一是使用不同稀释度的病毒样本(包括关切变异株 VOCs)构建浓度梯度,通过 10 倍稀释系列样本评估检测方法的敏感性;二是引入含人类冠状病毒或 MERS-CoV 的阴性样本,验证检测方法的特异性;三是利用数字 PCR(dPCR)技术对样本的病毒 RNA 载量进行绝对定量,为 EQA 样本提供参考值;四是收集各实验室的检测结果,通过统计分析评估不同检测系统的性能差异。此外,研究还引入了参考材料(RM1 和 RM2),用于实验室对自身检测系统的校准和性能验证。

研究结果


首轮 EQA 计划(2020 年 4 月)


  • 采用包含 4 个 SARS-CoV-2 阳性样本(10 倍稀释系列)和 3 个阴性样本的检测组合,发现阳性样本的正确检出率在 93.0%-99.7%,阴性样本的正确排除率在 92.4%-98.6%。
  • 不同检测系统对同一阳性样本的循环阈值(Ct/Cq)差异显著,部分检测系统对低浓度样本(如 1:1000000 稀释)的检出率降至 93%,提示低病毒载量检测存在挑战。
  • 实验室自建方法(LDTs)与商业试剂盒的定性检测性能相当,但定量结果差异较大,反映出缺乏统一参考标准的问题。

第二轮 EQA 计划(2020 年 6 月)


  • 引入预定量的 “揭示样本”(1570 copies/mL,通过 dPCR 确定),发现低病毒载量样本(如 452 copies/mL)的阳性检出率仅为 59.9%,表明检测系统的灵敏度存在差异。
  • 不同靶基因(如 N 基因、RdRP 基因)的检测性能出现分化,RdRP 基因在低浓度样本中的检出率较低,提示靶基因选择对检测结果有影响。
  • 数字 PCR(dPCR)的定量结果一致性优于传统定量 PCR(qPCR),凸显了 dPCR 在绝对定量中的优势。

参考材料的建立与应用(2020 年 11 月起)


  • 开发了 RM1(约 107 copies/mL)和 RM2(约 106 copies/mL)参考材料,通过多国计量机构的 dPCR 校准,为实验室提供了定量参考。
  • 实验室使用参考材料后,定量检测的准确性显著提升,尤其是对 VOCs 的检测,正确阳性率超过 93%,表明参考材料在统一检测标准中的关键作用。

长期监测与变异株适应性(2020 年 - 2023 年)


  • 后续 EQA 计划纳入 8 种 VOCs,发现检测系统对高病毒载量样本(>100000 copies/mL)的阳性检出率稳定在 95.8%-99.7%,但对低载量样本的性能仍受靶基因和检测系统影响。
  • 纵向分析显示,随着参考材料的普及和检测技术的优化,实验室对变异株的定量检测准确性从早期的 70%-80% 提升至后期的 93%-100%,反映出检测质量的持续改进。

研究结论与讨论


本研究通过强化的 EQA 计划,系统评估了 SARS-CoV-2 基因组检测的质量,揭示了检测系统在敏感性、特异性和定量准确性上的差异,证实了参考材料和数字 PCR 技术在统一检测标准中的重要性。研究表明,EQA 计划不仅能有效监控实验室检测性能,还能为新兴变异株的检测方法优化提供实时反馈。此外,研究首次建立了基于 dPCR 的定量参考体系,为临床判断病毒传播风险(如患者解除隔离标准)提供了科学依据。

该研究的重要意义在于构建了应对新发传染病的快速质量评估模型,其核心经验(如快速建立 EQA 体系、引入定量参考材料、动态纳入变异株)为未来疫情中病原体检测的标准化提供了可借鉴的 “蓝图”。同时,研究也强调了国际合作和专家网络在疫情应对中的关键作用,通过多国实验室的数据共享和技术协同,实现了检测质量的持续提升,为全球公共卫生安全提供了有力支撑。

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