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m6A调控的六基因铁死亡特征在肝细胞癌预后评估及治疗靶点发现中的关键作用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月28日 来源:Clinical and Experimental Medicine 3.2
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本研究针对肝细胞癌(HCC)预后预测难题,通过整合m6A甲基化与铁死亡相关基因(FRGs)调控网络,构建了包含VEGFA、FANCD2等6个关键基因的预后模型。研究人员采用多变量COX和LASSO回归分析TCGA数据库,发现高风险评分与不良预后显著相关,并证实ZFP69B通过调控CLSPN/HNRNPR促进肿瘤进展。该研究首次揭示m6A-FRGs特征在HCC免疫微环境调控中的作用,为个体化治疗提供新靶点,论文发表于《Clinical and Experimental Medicine》。
肝细胞癌(HCC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一,尽管近年来手术和免疫治疗取得进展,但患者5年生存率仍不足20%。这种严峻现状主要源于两个关键科学问题:一是缺乏精准的预后预测体系,二是肿瘤异质性导致治疗靶点匮乏。值得注意的是,m6A(RNA表观遗传修饰的重要形式)与铁死亡(铁依赖性程序性细胞死亡)在肿瘤发生发展中均发挥重要作用,但二者在HCC中的交叉调控机制尚未阐明。
南京大学等机构的研究团队通过系统分析TCGA和ICGC数据库,首次构建了基于m6A调控铁死亡相关基因的预后模型。研究发现,高风险患者不仅预后更差,其肿瘤微环境中免疫检查点分子(如PD-1、TIGIT)表达显著升高,提示该特征可指导免疫治疗人群筛选。更引人注目的是,研究者通过144例临床样本验证发现锌指蛋白ZFP69B作为核心调控因子,能通过下游靶基因CLSPN(染色体凝聚调控蛋白)和HNRNPR(核糖核蛋白)促进肿瘤转移。该成果为HCC的精准诊疗提供了新型生物标志物和干预靶点。
关键技术方法包括:1)从TCGA数据库获取374例HCC转录组数据,结合m6A2Target和FerrDb数据库筛选m6A相关铁死亡基因;2)采用LASSO-Cox回归构建六基因预后模型;3)通过siRNA沉默、Transwell实验等验证ZFP69B功能;4)利用144例临床样本队列进行免疫组化验证。
研究结果部分:
Identification of 55 m6A-related genes in the ferroptosis in HCC patients
通过生物信息学分析鉴定出55个与预后相关的m6A-FRGs,功能富集显示这些基因主要参与氧化应激反应和MAPK信号通路。
Profile of 55 m6A-related genes in the ferroptosis among HCC
共识聚类将患者分为两个亚群,Cluster 2患者生存期显著缩短,且与TNM分期呈正相关。
Construction of a prognostic signature model
建立的六基因模型(含EIF2S1、ZFP69B等)在训练集和验证集(ICGC)中均显示高风险组死亡风险增加2.3倍(HR=2.3, 95%CI 1.4-3.8)。
Immune microenvironment and gene mutations
高风险组TP53突变率高达42%,且免疫抑制性细胞(如MDSC)浸润增加,提示该群体可能更适合免疫联合治疗。
Silencing of ZFP69B inhibits HCC growth
功能实验证实ZFP69B敲除可使Huh7细胞迁移能力下降68%,其过表达患者3年生存率仅为31.2%(vs 低表达组62.4%)。
这项研究创新性地将RNA修饰与细胞死亡机制相结合,其重要意义体现在三方面:首先,m6A-FRGs特征突破了传统TNM分期的局限性,AUC达0.76的预测效能显著优于现有标志物;其次,发现ZFP69B-CLSPN轴为铁死亡调控提供了新机制;最后,研究提示高风险患者可能受益于m6A抑制剂(如METTL3抑制剂)联合免疫治疗的策略。这些发现为推进HCC的精准医学实践奠定了重要理论基础。
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