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为解决角膜感染病原难以及时精准鉴定的问题，研究人员开展真菌性角膜炎（FK）相关研究，通过 mNGS 检测角膜刮片，发现茄科匍柄霉（S. lycopersici）与人类 α 疱疹病毒 1 型混合感染，证实 mNGS 对病原鉴定和治疗的重要性。
角膜，这扇心灵的窗户，一旦被感染便可能蒙上 “阴霾”，甚至导致失明。在全球范围内，角膜感染尤其是真菌性角膜炎（Fungal Keratitis, FK）一直是致盲的重要元凶。传统检测手段如真菌培养耗时长、阳性率低，活体共聚焦显微镜（In Vivo Confocal Microscopy, IVCM）等虽能提供线索，却难以精准识别罕见病原体及混合感染。随着抗生素滥用和免疫抑制患者增多，真菌性角膜炎的诊治面临严峻挑战，如何快速揪出 “幕后黑手” 成为眼科医生的棘手难题。
为突破这一困境，电子科技大学四川省人民医院眼科团队开展了一项具有开创性的研究。他们接诊了一位 66 岁的特殊患者 —— 左眼因石屑划伤后经历长达数月的反复治疗，症状却持续恶化，传统检查始终未能明确病原体。研究团队通过角膜刮片的宏基因组下一代测序（Metagenomic Next-Generation Sequencing, mNGS）技术，首次在全球范围内确诊了由茄科匍柄霉（Stemphylium lycopersici）与人类 α 疱疹病毒 1 型（Human Alphaherpesvirus 1）引起的混合感染性角膜炎。该研究成果发表在《Journal of Ophthalmic Inflammation and Infection》，为复杂角膜感染的诊疗开辟了新路径。
研究中采用的核心技术包括：IVCM 用于初步提示真菌感染；角膜刮片进行 mNGS 检测，通过提取基因组 DNA、构建文库及高通量测序，精准识别病原体；同时进行传统的真菌和细菌培养作为对照。值得注意的是，患者样本的 mNGS 检测在排除污染和人源 DNA 后，成功锁定两种病原体的特异性序列，而传统培养结果为阴性，凸显了 mNGS 在检测非可培养病原体中的独特优势。
临床特征与病原鉴定
患者初始表现为结膜充血、角膜中央地图状溃疡（4 mm×5 mm）及白色纤维蛋白斑，IVCM 显示基质层真菌菌丝样高线性结构，初步诊断为真菌性角膜炎。然而，常规抗真菌治疗（如 5% 那他霉素）未能控制病情，溃疡持续扩大。此时，mNGS 检测发挥关键作用：结果显示茄科匍柄霉相对丰度达 94.91%，人类 α 疱疹病毒 1 型达 95.45%，明确了混合感染的病原构成，为后续治疗奠定基础。
治疗策略与转归
基于 mNGS 结果，治疗方案调整为联合用药：局部每小时滴注 1% 伏立康唑和 5% 那他霉素眼液，联合更昔洛韦凝胶及左氧氟沙星；全身给予伏立康唑静脉滴注和阿昔洛韦口服，并进行角膜溃疡周边基质及结膜下伏立康唑注射。由于病变广泛，患者接受了角膜病灶清除联合羊膜移植术。经过三个月的治疗，角膜溃疡基本愈合，视力逐步改善，证实了精准诊疗的有效性。
讨论：mNGS 的临床价值与挑战
该病例首次报道茄科匍柄霉作为人类角膜炎病原体，其感染可能与角膜外伤破坏免疫屏障相关。研究指出，混合感染的临床症状与单一感染相似，传统方法易漏诊，而 mNGS 能全面揭示病原体谱，避免因经验性治疗导致的耐药风险。此外，研究还强调了 mNGS 在监测病原体动态变化中的作用，例如区分主导病原体与污染菌，为调整治疗方案提供实时依据。
尽管 mNGS 展现出显著优势，传统微生物检测（如培养、IVCM）仍不可替代，二者结合可提高诊断准确性。该研究同时呼吁，在难治性角膜感染中应尽早引入 mNGS，以减少抗生素滥用，降低耐药性传播风险。
结论：精准医学时代的眼科突破
这项研究不仅填补了茄科匍柄霉致人类角膜炎的研究空白，更通过真实病例证实了 mNGS 在复杂感染性疾病中的诊断价值。在 “后抗生素时代”，mNGS 为角膜感染的快速精准诊疗提供了强有力的工具，其在识别罕见病原体、指导靶向治疗及遏制耐药性等方面的潜力，将有望改写眼科感染性疾病的诊疗范式，为更多濒临失明的患者带来重见光明的希望。
