线粒体 MT-TF 基因 m.591C>T 纯合变异的表型异质性:一项家族研究

【字体: 时间:2025年05月28日 来源:Egyptian Journal of Medical Human Genetics 1.2

编辑推荐:

  线粒体 tRNA 基因突变常致异质性临床症状。为探究 MT-TF 基因 m.591C>T 纯合变异特征,研究人员分析一家系,发现患儿表现肢体无力、电解质紊乱等 GS-like 表型,母亲患尿毒症等,该变异致 mt-tRNA 构象改变,为线粒体病诊断提供新视角。

  
线粒体作为细胞的 “能量工厂”,其基因变异引发的疾病一直是医学研究的难点与热点。线粒体转移 RNA(mt-tRNA)基因变异是线粒体 DNA(mtDNA)突变的常见类型,常因异质性导致复杂多样的临床表型,给精准诊断和机制解析带来挑战。Gitelman 综合征(GS)是一种常染色体隐性遗传的肾小管疾病,由 SLC12A3 基因突变导致远端肾小管 Na+-Cl-协同转运蛋白(NCC)功能障碍,表现为低镁血症、低钾血症等。而近年研究发现,线粒体基因 MT-TF(编码苯丙氨酸 mt-tRNA,mt-tRNAPhe)的 m.591C>T 等变异可引发类似 GS 的表型(GS-like),但该变异在不同个体间的临床差异及潜在机制尚不明确。在此背景下,湛江市中心人民医院的研究人员开展了一项家族性病例研究,旨在揭示 MT-TF 基因 m.591C>T 纯合变异的临床及分子特征,相关成果发表在《Egyptian Journal of Medical Human Genetics》。

为明确该变异的遗传特性与致病机制,研究团队对一个携带 MT-TF m.591C>T 变异的家族进行了多维度分析。研究采用三重全外显子测序(trio-WES)和高通量线粒体基因组测序,确认患儿及其母亲均携带该纯合变异,父亲未检测到相关突变。同时,运用 RNAfold 和 PyMOL 预测 mt-tRNAPhe 的二级、三级结构变化,通过 CLUSTALW 进行跨物种序列保守性分析,并结合 MITOMAP、ClinVar 等数据库评估变异致病性。

遗传分析与结构功能研究


测序结果显示,患儿 MT-TF 基因 m.591C>T 变异呈纯合状态(变异深度 6414/6450),母亲携带相同变异,符合线粒体遗传模式。结构预测表明,该变异导致 mt-tRNAPhe 的二氢尿嘧啶环(D 环)结构改变,自由能(ΔG)从 - 11.74 kcal/mol 降至 - 11.82 kcal/mol,提示结构稳定性增强,但三级结构发生显著构象变化。跨物种序列比对显示,MT-TF 基因第 591 位核苷酸在人类、大猩猩、小鼠等物种中高度保守,暗示该位点变异可能对 mt-tRNA 功能产生关键影响。

致病性评估与功能验证


通过多数据库整合分析,m.591C>T 变异在 MITOMAP 中被标注为致病性变异,与线粒体脑病、GS-like 表型相关;HelixMTdb 显示其在健康人群中频率为 0,gnomAD v3.1 中仅以极低频率(1/56,432)存在于异质状态。ClinVar 将其归类为 “致病性 / 可能致病性”,且在 7 个家族中与低镁血症、低钾血症共分离。功能研究引用 Viering 等的成果,发现该变异可损害线粒体氧化磷酸化(OXPHOS)复合体 IV 功能,抑制 NCC 磷酸化及钠重吸收,导致电解质紊乱。结合结构与功能证据,该变异被判定为致病性变异。

临床表型与治疗响应


患儿为 2 岁 10 个月男童,表现为肢体无力、颈部僵硬、语言发育迟缓、身材矮小及反复手足搐搦,伴低钠血症(128 mmol/L)、低钾血症(2.9 mmol/L)、低镁血症(0.49 mmol/L)。尽管 EEG、MRI 等检查未见异常,但电解质紊乱与 GS-like 表型吻合。母亲则表现为尿毒症、身材矮小、易疲劳,需规律透析,但无反复搐搦或电解质失衡。患儿经辅酶 Q10、艾地苯醌、左卡尼汀及维生素等治疗后,电解质恢复正常,运动和语言能力改善,提示对症支持治疗对线粒体功能障碍有效。

讨论与意义


本研究首次报道 MT-TF m.591C>T 纯合变异在同一家系中的显著表型异质性:患儿以神经肌肉症状和电解质紊乱为主,母亲则以肾脏损伤为突出表现。这种差异可能与组织特异性突变负荷、修饰基因或环境因素有关。例如,肾小管上皮细胞对能量需求较高,突变可能导致 ATP 持续缺乏,引发间质性纤维化;而儿童期神经发育对能量波动更敏感,导致发育延迟。结构分析显示,变异虽增强 mt-tRNAPhe 稳定性,但可能干扰其与核糖体的相互作用,影响线粒体蛋白合成,进而损害 OXPHOS 复合体功能,最终导致多系统受累。

研究首次发现该变异可导致颈部僵硬、语言延迟等新表型,扩展了 MT-TF 变异的临床谱。同时强调,对于 GS-like 表型患者,除筛查核基因外,需警惕线粒体变异可能,尤其是母系遗传病例。此外,线粒体基因治疗(如腺相关病毒载体、碱基编辑技术)的发展为根治此类疾病提供了潜在方向,尽管目前仍处于动物模型阶段,但其在纠正 mtDNA 突变中的应用前景值得期待。

综上,该研究通过家族病例结合多组学分析,揭示了 MT-TF m.591C>T 变异的致病性机制与表型复杂性,强调了整合遗传、结构和功能分析在 mitochondrial disease 精准诊断中的重要性,为临床鉴别诊断及个体化治疗提供了新依据。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号