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为解决非结核分枝杆菌（NTM）因培养资源需求大导致的诊断难题，研究人员针对糖尿病（DM）和慢性肾病（CKD）患者的 NTM 分离株，开展 Xpert MTB/RIF Ultra 及 Xpert MTB/RIF 检测的探针扩增研究。结果显示多数 NTM 存在探针扩增，为 NTM 诊断提供新思路。
在结核病（TB）诊断领域，快速准确区分结核分枝杆菌复合群（MTBC）与非结核分枝杆菌（NTM）一直是临床难题。NTM 感染症状与 TB 相似，但治疗方案差异显著，且传统分枝杆菌培养耗时长、资源需求高，尤其在糖尿病（DM）、慢性肾病（CKD）等免疫力低下人群中，NTM 感染率上升却缺乏高效诊断手段。现有的 Xpert MTB/RIF 等分子诊断技术虽广泛应用于 TB 检测，但其对 NTM 的检测能力及潜在交叉反应尚不明确。因此，探究 NTM 在 Xpert 系列检测中的探针扩增特征，对优化临床诊断流程、避免漏诊误诊具有重要意义。
埃塞俄比亚公共卫生研究所与亚的斯亚贝巴大学阿克利卢?莱玛病理生物学研究所的研究人员，针对 DM 和 CKD 患者中分离的 NTM 开展研究，相关成果发表于《Scientific Reports》。该研究旨在分析 Xpert MTB/RIF Ultra（Xpert Ultra）和 Xpert MTB/RIF 检测对不同 NTM 物种的探针扩增情况，评估混合感染及其他细菌对检测的影响，并探索临床标本中探针扩增与 NTM 存在的关联。
研究主要采用以下技术方法：①收集 DM（41 株）和 CKD（46 株）患者来源的 87 株 NTM 临床分离株及 7 株 NTM 标准菌株（ATCC），进行 Xpert Ultra 和 Xpert MTB/RIF 检测；②分析 97 份 Xpert Ultra 阴性但存在探针扩增的临床标本，通过培养鉴定 NTM；③运用 SPSS 27 进行统计分析，采用曼 - 惠特尼 U 检验和克鲁斯卡尔 - 沃利斯检验比较循环阈值（CT 值）差异。
Xpert 检测对 NTM 的探针扩增特征
- 扩增频率与探针类型：87 株 NTM 在 Xpert Ultra 中均呈阴性，但 88.5% 存在至少 1 个探针扩增，以 rpoB2（88.5%）为主，其次为 rpoB4（11.5%）；Xpert MTB/RIF 中 78.2% 存在探针扩增，以 Probe C（73.6%）为主。NTM 标准菌株中，5 株出现 rpoB2 扩增，提示 rpoB 区域保守序列可能引发交叉反应。
- CT 值差异：Xpert Ultra 中 rpoB2、rpoB4、rpoB1 的中位 CT 值分别为 28.3、30.55、30.9，不同 NTM 物种间 rpoB2 CT 值存在显著差异（χ2=18.857，P=0.016），如鸟分枝杆菌复合群（M. avium complex）CT 值较高，戈登分枝杆菌（M. gordonae）等较低。Xpert MTB/RIF 中 Probe C 中位 CT 值为 29.2，不同物种间亦有差异（χ2=13.199，P=0.041）。
临床标本与混合感染分析
- 标本培养验证：97 份 Xpert Ultra 阴性标本中，13.4%（13 份）经培养鉴定为 NTM，且 NTM 阳性标本的 rpoB2 CT 值显著低于阴性标本（χ2=2.949，P=0.015），提示低 CT 值可能与活菌存在相关。
- 混合感染影响：NTM 与 MTBC 混合感染或共存其他革兰氏阳性 / 阴性细菌时，不影响 Xpert Ultra 的探针扩增结果，表明检测特异性主要受 MTBC 靶序列驱动，NTM 的交叉反应不干扰 TB 诊断。
与 MTBC 的检测差异
MTBC 分离株在 Xpert Ultra 中均显示 IS6110/IS1081 及全 rpoB 探针扩增，且 rpoB2、rpoB4 CT 值显著低于 NTM（P<0.001），反映 MTBC 的高载量特征与 NTM 的弱信号差异，可作为区分两者的潜在指标。
研究结论与意义：本研究证实 NTM 在 Xpert Ultra 和 Xpert MTB/RIF 中普遍存在 rpoB 区域探针扩增，尤以 rpoB2 和 Probe C 为主，且 CT 值差异与物种相关。临床标本中，Xpert Ultra 阴性但存在探针扩增（尤其是低 CT 值）时，需警惕 NTM 感染可能。尽管 Xpert 系列检测仍以 MTBC 为主要靶标，但其探针扩增模式可为 NTM 的辅助诊断提供线索，尤其在资源有限地区，结合临床特征与培养结果，有望优化 NTM 的早期识别。未来需扩大样本量，进一步验证探针扩增在 NTM 诊断中的临床价值，并探索全基因组测序等技术在机制研究中的应用。
