FOXO4-DBD与p53-TAD结构可塑性互作机制解析:衰老相关疾病治疗新靶点

【字体: 时间:2025年05月28日 来源:Nature Communications 14.7

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  本研究针对FOXO4与p53转录因子在衰老调控中的关键作用,通过核磁共振(NMR)和分子模拟技术揭示了FOXO4 DNA结合域(DBD)与p53转录激活域(TAD)的异质性互作模式。研究发现p53-TAD通过多结合位点与FOXO4-DBD的N端螺旋束动态结合,且磷酸化修饰可增强其亲和力。该成果发表于《Nature Communications》,为开发靶向衰老细胞的溶衰老(senolytic)药物提供了结构基础。

  

细胞衰老是机体衰老和癌症等疾病的重要驱动因素,其中转录因子FOXO4和p53的相互作用通过调控p21表达促进衰老细胞存活。然而,FOXO4的叉头DNA结合域(Forkhead DBD)与p53转录激活域(TAD)的互作机制长期不明,这阻碍了靶向干预策略的开发。捷克科学院生理研究所的Klara Kohoutova等团队在《Nature Communications》发表研究,首次解析了这一动态复合物的结构特征。

研究采用核磁共振(NMR)弛豫测量、顺磁弛豫增强(PRE)和HADDOCK分子对接技术,结合荧光各向异性(FA)结合实验。通过构建FOXO4-DBD(残基86-211)和p53-TAD(残基1-93)的15N标记蛋白及单半胱氨酸突变体,获取距离约束参数用于建模。

FOXO-DBDs与p53-TAD的差异结合特性
化学位移扰动(CSP)分析显示,FOXO家族成员(FOXO1/3/4)的DBD均通过N端螺旋束(如FOXO4的N99/W101)结合p53-TAD的TAD2区域(M40-W53),但亲和力差异显著(FOXO3-DBD KD=1.2μM,FOXO4-DBD KD=42μM)。

复合物中p53-TAD的构象变化
PRE-NMR实验表明,p53-TAD结合后形成更紧凑的构象,但其TAD1(F19-L26)和TAD2(I50-F54)仍保持高度柔性。弛豫测量(R2/R1)证实FOXO4-DBD核心区(100-185)刚性增强,而p53-TAD仅部分区域动态性降低。

多模式结合的分子机制
基于617个PRE距离约束的HADDOCK模型显示,p53-TAD以可变构象结合FOXO4-DBD的N端片段(86-106)和H3/H4螺旋界面。关键疏水残基(如p53的W53/F54)突变会削弱结合,而磷酸化模拟突变(S46E/T55E)则增强亲和力达3倍,提示翻译后修饰的调控作用。

DNA结合的竞争效应
FOXO4-DBD的p53和DNA结合表面存在重叠,DBE基序(5'-GACTATGTAAACAACGC-3')可竞争性解离p53-TAD,解释了FOXO4抑制p53-DNA结合的分子基础。

该研究揭示了FOXO4:p53互作的高度动态性,为设计靶向N端螺旋束的小分子或肽类senolytic药物提供了精确蓝图。这种策略有望选择性清除衰老细胞,改善组织稳态。此外,磷酸化对结合亲和力的调控提示应激条件下该通路的可塑性,为衰老相关疾病的干预开辟了新途径。

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