从桐花树根部分离的新型内生细菌:桐花树共生菌(Consotaella aegiceratis sp. nov.)的发现与分类学研究

【字体: 时间:2025年05月28日 来源:Current Microbiology 2.3

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  来自中国广西的研究团队从山口红树林生态保护区的桐花树根部分离出一株新型革兰氏阴性短杆状内生菌CSK11QG-6T。通过16S rRNA基因序列分析(96.5%相似性)和全基因组特征(5.42 Mbp,GC含量64.8%),结合低于物种界定阈值的ANI(95-96%)和dDDH(70%)值,证实其为Consotaella属新种,命名为Consotaella aegiceratis sp. nov.。该研究为微生物资源开发和红树林生态系统研究提供了重要菌种材料。

  

科研团队在中国广西山口红树林国家级自然保护区开展了一项有趣的微生物探索,从桐花树(Aegiceras corniculatum)根部成功捕获了一株"微生物新兵"——CSK11QG-6T菌株。这株革兰氏阴性、好氧的短杆状细菌可不简单,显微镜下能看到它活泼地摆动鞭毛四处游动。

通过微生物分类学的"分子身份证"16S rRNA基因比对,发现它与最近亲Consotaella salsifontis USBA 369T的相似度仅有96.5%,已经亮起了新物种的警示灯。科研人员又动用了基因组"大杀器":5.42兆碱基的基因组拼图中,N50达到97.8 kb,测序深度高达138倍。更关键的是,当计算基因组相似度的两个金标准——平均核苷酸同源性(ANI)和数字DNA-DNA杂交(dDDH)值时,结果都低于物种划分的临界值(95-96%和70%),这相当于给新物种颁发了"出生证明"。

化学分析揭示了这个微生物小精灵的"生活偏好":最爱C18:1ω7c和C16:0这两种脂肪酸,呼吸链上挂着泛醌-10(Q-10)作为能量传递的"小电池",细胞膜上则装饰着磷脂酰甘油(PG)、磷脂酰胆碱(PC)等多样化的极性脂质。虽然这些特征与Consotaella属的"家族特征"相符,但表型特征的显著差异让它脱颖而出。

最终,这个集基因组学、化学分类学和表型分析于一身的综合研究,为微生物大家族增添了一位新成员——桐花树共生菌(Consotaella aegiceratis sp. nov.),其模式菌株CSK11QG-6T已保藏于中国海洋微生物菌种保藏中心(MCCC 1K07176T)和日本微生物保藏中心(JCM 35044T)。这项发现不仅丰富了Consotaella属的多样性,更为研究红树林特殊生境中的微生物-植物互作提供了珍贵材料。

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