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为明确韩国沿海水源细菌新类群分类地位,研究人员开展革兰氏阴性菌 KMU-169T多相分类研究。发现其属Paracoccaceae科新属新种,命名为Pontitalea aquivivens,且基因组含生物大分子降解相关基因,具工业酶开发潜力。
从韩国沿海水域分离到一株革兰氏阴性、杆状、严格需氧、不运动的化能有机异养 α- 变形菌,编号 KMU-169T。该菌株可在 0–2.0% NaCl 浓度(w/v)、pH 6.0–9.5 和 15–40°C 条件下生长。基于 16S rRNA 基因序列分析表明,菌株 KMU-169T属于Paracoccaceae科,与 “Defluviimonas salinarum” CAU 1641T相似度最高(97.0%)。主要(>10%)细胞脂肪酸为 C18:1 ω7c和总和特征 3(包含 C16:1 ω6c和 / 或 C16:1 ω7c)。主要呼吸醌为泛醌 - 10(ubiquinone-10)。KMU-169T菌株含有磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油、二磷脂酰甘油、磷脂酰胆碱、一种未鉴定氨基脂、一种未鉴定磷脂和一种未鉴定脂类。组装的 draft 基因组大小为 4.1 Mbp,DNA G+C 含量为 65.0%。该菌株与近缘分类单元的平均核苷酸同一性(ANI)、平均氨基酸同一性(AAI)和数字 DNA-DNA 杂交(dDDH)值分别为 71.9–76.8%、60.9–76.1% 和 18.4–21.0%。基因组显示存在大量参与生物大分子降解的基因,表明其具有产生工业有价值酶的高潜力。基于本研究的多相分类学数据,提出Paracoccaceae科的一个新属和新种,命名为Pontitalea aquivivens gen. nov., sp. nov.,模式菌株为 KMU-169T(= KCCM 90598T = NBRC 117093T)。