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本文聚焦铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)染色体 β- 内酰胺酶 AmpC(PDC)氨基酸变异,探究其对头孢地尔(cefiderocol)等抗生素耐药的影响。发现 E219K 和 L293P 变异通过不同酶学机制增强头孢地尔水解,为临床应对耐药提供新视角。
研究背景与目的
铜绿假单胞菌是革兰氏阴性病原菌,其通过水平基因转移获得广谱耐药机制(如超广谱 β- 内酰胺酶 ESBLs、金属 β- 内酰胺酶)的能力令人担忧。新型 β- 内酰胺 /β- 内酰胺酶抑制剂组合(如头孢他啶 / 阿维巴坦、头孢洛扎 / 他唑巴坦)虽已上市,但耐药菌株不断涌现。头孢地尔是近年获批的新型 β- 内酰胺抗生素,其独特的氯邻苯二酚基团可通过铁载体介导途径穿透周质空间(“特洛伊木马” 机制),但对其耐药机制的研究尚不充分,尤其是铜绿假单胞菌固有 PDC β- 内酰胺酶的氨基酸变异影响。本研究旨在解析 PDC 变异对头孢地尔耐药的分子机制。
材料与方法
利用构建的野生型(PAO1)和铁摄取缺陷型(PAO ΔpiuC)铜绿假单胞菌分离株,表达 19 种 PDC 关键催化区域变异体。通过肉汤微量稀释法测定抗生素最低抑菌浓度(MIC),纯化 PDC-1、E219K 和 L293P 变异体并测定动力学参数(Km、kcat、kcat/Km),结合分子动力学(MD)模拟分析变异体结构变化。
关键结果
1. PDC 变异对头孢地尔耐药的不同影响
多数 PDC 变异体对头孢地尔 MIC 影响较小,但 Ω-loop 的 E219K 和螺旋 H10 的 L293P 变异显著升高头孢地尔 MIC。在 PAO ΔpiuC背景下,E219K、L293P 等变异体的头孢地尔 MIC 达 32–64 mg/L。E219K 对头孢洛扎 / 他唑巴坦耐药影响显著,而 L293P 更倾向于影响头孢吡肟和头孢地尔耐药。
2. 动力学机制差异
- E219K 变异:通过提高催化速率(kcat)增强水解能力,其对头孢地尔的kcat较野生型提高约 125 倍(从 0.0036 s-1至 0.45 s-1),但底物结合亲和力(Km)下降(从 85.29 μM 至 465.64 μM)。
- L293P 变异:通过降低Km提升底物结合亲和力,对头孢地尔的Km降至 2.69 μM(野生型 85.29 μM),kcat/Km提高 33.75 倍。
3. 结构机制解析
MD 模拟显示,E219K 通过增强 Ω-loop 刚性,促进头孢地尔 R1基团与催化丝氨酸的亲核攻击;L293P 使螺旋 H10 折叠减少,通过与头孢地尔 R2基团形成更强氢键,优化活性位点结合。E219K 的 Ω-loop 与螺旋 H5 的 E171 形成静电作用,限制构象灵活性;L293P 则增加 H9–H10 环柔性,扩大结合口袋。
讨论与意义
本研究揭示 PDC 的 E219K 和 L293P 变异分别通过 “提高催化效率” 和 “增强结合亲和力” 两条路径介导头孢地尔耐药,且与头孢洛扎、头孢吡肟等存在交叉耐药机制。临床需警惕铜绿假单胞菌在抗生素压力下通过 PDC 变异快速进化耐药性,尤其是铁摄取缺陷与 PDC 变异协同导致的高 MIC 表型。研究为预测耐药进化、开发新型抑制剂提供了结构与机制依据,强调动态监测 PDC 变异在抗铜绿假单胞菌治疗中的重要性。
结论
PDC β- 内酰胺酶可通过 E219K 和 L293P 变异利用头孢地尔与其他头孢菌素的结构相似性加速水解,展现了铜绿假单胞菌耐药机制的复杂性与适应性。未来需结合临床菌株监测与结构生物学手段,进一步优化抗生素使用策略,延缓耐药性传播。