综述:利用技术手段解析胃癌异质性

【字体: 时间:2025年05月28日 来源:TRENDS IN Cancer 14.3

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  这篇综述系统阐述了如何通过整合基因组学(Genomics)、蛋白质组学(Proteomics)和单细胞空间分析等新兴技术,揭示胃癌(GC)的高度异质性。文章强调多组学(Multi-omics)联用为精准治疗提供了新靶点,并展望了技术驱动下个性化治疗的突破方向。

  

Highlights

胃癌是一种分子高度异质性的疾病,其编码区与非编码区突变的多样性导致治疗困难。近年来,蛋白质组学(Proteomics)、蛋白质基因组学(Proteogenomics)、微生物组分析和单细胞空间技术的突破,显著提升了对胃癌生物学机制的解码能力。多组学整合不仅直接锁定可靶向蛋白及其修饰(如磷酸化),更为个体化治疗提供了精确路线图。

Abstract

胃癌的发生涉及复杂致癌因素相互作用,由于缺乏明确驱动基因突变和显著的肿瘤异质性,治疗选择有限。最新研究通过结合基因组学与前沿技术,实现了对胃癌异质性的系统性解析。分子改变图谱的绘制和特定亚型的靶向干预,将提升治疗效果。本文综述了当前胃癌研究的技术体系,包括基于多组学的关键发现和创新策略,并探讨了技术导向的未来突破方向。

技术驱动的胃癌异质性解码

传统组织活检难以捕捉胃癌的空间异质性,而单细胞RNA测序(scRNA-seq)结合空间转录组(Spatial Transcriptomics)技术,可揭示肿瘤微环境中上皮细胞、免疫细胞和间质细胞的动态互作。例如,某些研究通过scRNA-seq发现CLDN18-ARHGAP26融合基因在弥漫型胃癌中的亚群特异性表达。

蛋白质基因组学(Proteogenomics)将基因组变异与蛋白质功能关联,如磷酸化蛋白质组鉴定到EGFR信号通路在肠型胃癌中的异常激活,这为克服赫赛汀(Herceptin)耐药提供了新靶点。微生物组分析则显示幽门螺杆菌(H. pylori)感染通过诱导宿主基因组不稳定性和表观遗传修饰(如DNA甲基化),促进肿瘤发生。

多组学整合与精准治疗

基于质谱的蛋白质组学(MS-Proteomics)筛选到CDH17、MET等膜蛋白可作为液体活检标志物。CRISPR筛选联合类器官模型验证了Wnt/β-catenin通路抑制剂对特定分子亚型的敏感性。值得注意的是,非编码RNA(如lncRNA MALAT1)通过调控mRNA稳定性影响转移表型,这为RNA靶向疗法(RNA-targeting therapy)提供了依据。

未来展望

空间多组学(Spatial Multi-omics)和人工智能驱动的数据整合将成为研究热点。例如,深度学习模型预测肿瘤进化轨迹,或可提前干预耐药克隆。此外,微生物组-宿主互作和表观遗传调控(如m6A修饰)的深入探索,有望开辟全新治疗维度。

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